174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3965 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  66.18 
 
 		 548 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  66.85 
 
 		 548 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  100 
 
 		 547 aa  1064    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  62.39 
 
 		 548 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  57.43 
 
 		 542 aa  521  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  39.63 
 
 		 563 aa  355  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  38.89 
 
 		 558 aa  334  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.2 
 
 		 577 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  38.42 
 
 		 565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  37.16 
 
 		 558 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  37.16 
 
 		 558 aa  321  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  37.52 
 
 		 560 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  37.76 
 
 		 582 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.7 
 
 		 556 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  37.57 
 
 		 582 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.7 
 
 		 556 aa  317  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.15 
 
 		 576 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.42 
 
 		 549 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  45.73 
 
 		 561 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.13 
 
 		 552 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  45.16 
 
 		 564 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  44.78 
 
 		 561 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  36.28 
 
 		 557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.09 
 
 		 559 aa  306  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  35.98 
 
 		 563 aa  302  9e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  38.06 
 
 		 548 aa  300  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.78 
 
 		 562 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.53 
 
 		 553 aa  299  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.67 
 
 		 552 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.65 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.64 
 
 		 565 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  38.76 
 
 		 543 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  38.76 
 
 		 543 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  38.76 
 
 		 543 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  38.76 
 
 		 543 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  38.76 
 
 		 543 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  35.51 
 
 		 556 aa  293  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.23 
 
 		 548 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  37.5 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.74 
 
 		 552 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.74 
 
 		 552 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.74 
 
 		 552 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.04 
 
 		 548 aa  289  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  36.53 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  37.83 
 
 		 543 aa  287  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.89 
 
 		 543 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  35.48 
 
 		 550 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  36.3 
 
 		 565 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  37.45 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.45 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  36.3 
 
 		 548 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  37.45 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.45 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  37.45 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  37.45 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  37.45 
 
 		 543 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  37.43 
 
 		 543 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.84 
 
 		 548 aa  280  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.26 
 
 		 561 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  35.86 
 
 		 550 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  35.32 
 
 		 561 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.09 
 
 		 553 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.6 
 
 		 562 aa  273  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.3 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.78 
 
 		 570 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.66 
 
 		 546 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  34.96 
 
 		 578 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.68 
 
 		 563 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.94 
 
 		 566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  32.2 
 
 		 535 aa  243  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  30.05 
 
 		 562 aa  238  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  34.85 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  26.62 
 
 		 537 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  26.62 
 
 		 537 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  33.33 
 
 		 548 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.86 
 
 		 556 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.2 
 
 		 567 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.04 
 
 		 558 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28 
 
 		 536 aa  198  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.56 
 
 		 541 aa  194  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.12 
 
 		 541 aa  193  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.85 
 
 		 541 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.46 
 
 		 643 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.23 
 
 		 541 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  37.66 
 
 		 555 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  37.45 
 
 		 555 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.23 
 
 		 548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.55 
 
 		 590 aa  174  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.37 
 
 		 564 aa  170  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  27.39 
 
 		 559 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.42 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  24.48 
 
 		 551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.23 
 
 		 559 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  23.77 
 
 		 551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  23.77 
 
 		 551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.85 
 
 		 549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  24.11 
 
 		 551 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  24.25 
 
 		 551 aa  163  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.31 
 
 		 538 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  24.06 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>