16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3947 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3947  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  436  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0213585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1935  hypothetical protein  48.39 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0472  hypothetical protein  47.69 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2588  hypothetical protein  46.28 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1246  hypothetical protein  45.74 
 
 		 197 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0031  hypothetical protein  43.93 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5007  hypothetical protein  41.14 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536268  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5311  hypothetical protein  41.62 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1803  hypothetical protein  39.2 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0310445  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0024  hypothetical protein  37.3 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2187  hypothetical protein  36.95 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1852  hypothetical protein  36.45 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2715  hypothetical protein  36.07 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1584  hypothetical protein  30.77 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5949  hypothetical protein  27.84 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0250  hypothetical protein  35.71 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66839  normal  0.167361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>