98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3883 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3883  myo-inositol-1-phosphate synthase  100 
 
 
367 aa  749    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397744  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2694  myo-inositol-1-phosphate synthase  71.51 
 
 
571 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1160  myo-inositol-1-phosphate synthase  70.42 
 
 
356 aa  547  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0382  myo-inositol-1-phosphate synthase  70.14 
 
 
356 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.196157  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1794  Myo-inositol-1-phosphate synthase  69.64 
 
 
361 aa  541  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0509898  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3367  myo-inositol-1-phosphate synthase  68.54 
 
 
381 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00885843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4642  Myo-inositol-1-phosphate synthase  71.79 
 
 
362 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00394531  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1263  Myo-inositol-1-phosphate synthase  69.08 
 
 
363 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0100995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2585  myo-inositol-1-phosphate synthase  70.19 
 
 
362 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0243  myo-inositol-1-phosphate synthase  70.06 
 
 
365 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.121242  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1314  myo-inositol-1-phosphate synthase  73.18 
 
 
360 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0189  Myo-inositol-1-phosphate synthase  69.49 
 
 
365 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0503  myo-inositol-1-phosphate synthase  67.88 
 
 
363 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0394  Myo-inositol-1-phosphate synthase  64.56 
 
 
402 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0979  myo-inositol-1-phosphate synthase family protein  63.54 
 
 
370 aa  511  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00718854  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_852  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.54 
 
 
370 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000625636  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0870  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.26 
 
 
370 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3568  inositol 1-phosphate synthase  65.82 
 
 
359 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.988412 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0037  Myo-inositol-1-phosphate synthase  66.38 
 
 
359 aa  496  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0291539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3099  myo-inositol-1-phosphate synthase  66.95 
 
 
359 aa  495  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2138  myo-inositol-1-phosphate synthase  65.92 
 
 
359 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4958  inositol 1-phosphate synthase  64.51 
 
 
359 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5081  myo-inositol-1-phosphate synthase  65.82 
 
 
359 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4563  myo-inositol-1-phosphate synthase  64.97 
 
 
359 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459247  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9365  putative myo-inositol-1-phosphate synthase  63.94 
 
 
359 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279573  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39310  inositol 1-phosphate synthase  64.33 
 
 
362 aa  485  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5074  inositol 1-phosphate synthase  64.41 
 
 
359 aa  485  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.491686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4846  inositol 1-phosphate synthase  64.19 
 
 
363 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7031  inositol 1-phosphate synthase  62.6 
 
 
363 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4529  myo-inositol-1-phosphate synthase  64.97 
 
 
357 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0790  Myo-inositol-1-phosphate synthase  63.53 
 
 
390 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0238913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5921  Myo-inositol-1-phosphate synthase  63.74 
 
 
359 aa  478  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1276  putative inositol 1-phosphate synthase  63.31 
 
 
380 aa  475  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7318  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.56 
 
 
357 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0867  myo-inositol-1-phosphate synthase  62.67 
 
 
362 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0347  inositol 1-phosphate synthase  62.25 
 
 
359 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.745624  normal  0.0558836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5376  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.64 
 
 
359 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.816285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5465  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.64 
 
 
359 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0339184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6040  myo-inositol-1-phosphate synthase  62.95 
 
 
362 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186898  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5752  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.64 
 
 
359 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780572  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37840  inositol 1-phosphate synthase  61.62 
 
 
363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5384  inositol 1-phosphate synthase  63.84 
 
 
359 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4678  myo-inositol-1-phosphate synthase  62.57 
 
 
361 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4748  inositol 1-phosphate synthase  62.15 
 
 
363 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26610  inositol 1-phosphate synthase  60.73 
 
 
359 aa  461  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3359  inositol 1-phosphate synthase  62.67 
 
 
364 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10045  myo-inositol-1-phosphate synthase ino1  61.8 
 
 
367 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.723979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4195  inositol 1-phosphate synthase  61.28 
 
 
370 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4201  inositol 1-phosphate synthase  62.99 
 
 
357 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3703  inositol 1-phosphate synthase  61.56 
 
 
364 aa  458  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2528  inositol 1-phosphate synthase  61.17 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2905  myo-inositol-1-phosphate synthase  59.78 
 
 
388 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23300  myo-inositol-1-phosphate synthase  60.06 
 
 
361 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2614  inositol 1-phosphate synthase  60.06 
 
 
361 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0149613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3509  Myo-inositol-1-phosphate synthase  61.08 
 
 
360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0974  myo-inositol-1-phosphate synthase  57.18 
 
 
367 aa  424  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.505463  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0258  Myo-inositol-1-phosphate synthase  55.46 
 
 
369 aa  418  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0276  myo-inositol-1-phosphate synthase  55.71 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1040  myo-inositol-1-phosphate synthase  54.42 
 
 
366 aa  408  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0676  Myo-inositol-1-phosphate synthase  53.59 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.639702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2381  myo-inositol-1-phosphate synthase  53.87 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2981  myo-inositol-1-phosphate synthase  53.19 
 
 
387 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1378  Myo-inositol-1-phosphate synthase  54.32 
 
 
375 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0101  myo-inositol-1-phosphate synthase  52.62 
 
 
366 aa  385  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0649  myo-inositol-1-phosphate synthase  48.48 
 
 
364 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1868  Myo-inositol-1-phosphate synthase  49.02 
 
 
359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1693  myo-inositol-1-phosphate synthase  49.57 
 
 
359 aa  323  2e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.23989 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0544  myo-inositol-1-phosphate synthase  46.76 
 
 
351 aa  288  7e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1653  myo-inositol-1-phosphate synthase  41.11 
 
 
354 aa  286  5.999999999999999e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.470823  hitchhiker  0.00129381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3127  Myo-inositol-1-phosphate synthase  40.32 
 
 
406 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1335  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1718  myo-inositol-1-phosphate synthase  43.02 
 
 
351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.537693  normal  0.11872 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0738  myo-inositol-1-phosphate synthase  43.98 
 
 
351 aa  266  4e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0753  myo-inositol-1-phosphate synthase  43.66 
 
 
351 aa  265  8e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.170909 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1904  L-myo-inositol-1-phosphate synthase  38.81 
 
 
341 aa  220  3e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0868076 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1307  Myo-inositol-1-phosphate synthase  35.51 
 
 
344 aa  208  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.74041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1373  myo-inositol-1-phosphate synthase  26.85 
 
 
382 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0205603  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1313  myo-inositol-1-phosphate synthase  26.7 
 
 
382 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00015113  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1660  myo-inositol-1-phosphate synthase  27.41 
 
 
387 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1026  Inositol-3-phosphate synthase  30.66 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1982  inositol-3-phosphate synthase  31.63 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0777  Myo-inositol-1-phosphate synthase  31.82 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.285259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2324  Inositol-3-phosphate synthase  28.88 
 
 
386 aa  59.7  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0365735  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3598  inositol-3-phosphate synthase  26.56 
 
 
396 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2801  Inositol-3-phosphate synthase  26.04 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2277  inositol-3-phosphate synthase  25.76 
 
 
438 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2679  inositol-3-phosphate synthase  26.04 
 
 
423 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11090  myo-inositol-1-phosphate synthase  28.19 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4149  inositol-3-phosphate synthase  27.41 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4280  Inositol-3-phosphate synthase  27.41 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2906  Inositol-3-phosphate synthase  26.04 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.0937533 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4302  Inositol-3-phosphate synthase  27.41 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2291  inositol-3-phosphate synthase  26.04 
 
 
396 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.0325155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2332  Inositol-3-phosphate synthase  24.87 
 
 
438 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2420  Inositol-3-phosphate synthase  24.87 
 
 
438 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0243061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1535  inositol-3-phosphate synthase  24.37 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1213  inositol-3-phosphate synthase  24.11 
 
 
451 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0688  inositol-3-phosphate synthase  24.11 
 
 
443 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1195  Inositol-3-phosphate synthase  23.27 
 
 
442 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>