More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3865 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  87.08 
 
 		 241 aa  431  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  74.9 
 
 		 240 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 		 240 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  68.2 
 
 		 240 aa  346  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  66.24 
 
 		 240 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 247 aa  285  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  56.67 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  57.32 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 240 aa  277  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  58.16 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.9 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.49 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  56.07 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.46 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  58.16 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  56.07 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  56.07 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  57.26 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.9 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.65 
 
 		 246 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.49 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  54.81 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.42 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  56.3 
 
 		 262 aa  271  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  56.49 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.8 
 
 		 263 aa  271  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  56.07 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.23 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.81 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.88 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.07 
 
 		 242 aa  271  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  56.43 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  55.6 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  54.81 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  56.12 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  54.81 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  55 
 
 		 247 aa  269  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  55.04 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.23 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 		 243 aa  268  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.39 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.56 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  54.39 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.55 
 
 		 248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  54.58 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  55.23 
 
 		 252 aa  268  7e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  57.63 
 
 		 241 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  54.96 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.96 
 
 		 242 aa  268  8e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  57.32 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  58.05 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  56.72 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  54.55 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  54.13 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  54.17 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  55.83 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  56.6 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  55.83 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.39 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  55.83 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.49 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  55.42 
 
 		 249 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  54.17 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.42 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  56.2 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  54.81 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  56.3 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  55.19 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  53.97 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  56.2 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  54.17 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  54.58 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  55.37 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.12 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  53.33 
 
 		 360 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  54.77 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  53.14 
 
 		 251 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  56.49 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.81 
 
 		 239 aa  265  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  53.72 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.04 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.36 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  56.36 
 
 		 239 aa  263  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  55.65 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.23 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  53.56 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  56.78 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  53.56 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>