More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3825 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  73.88 
 
 
694 aa  1037    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  100 
 
 
695 aa  1419    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  75.18 
 
 
694 aa  1073    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  75.64 
 
 
700 aa  1083    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  61.09 
 
 
334 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  61.4 
 
 
334 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  48.04 
 
 
333 aa  323  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  50.45 
 
 
331 aa  320  7e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  46.48 
 
 
333 aa  308  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  48.35 
 
 
333 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  47.54 
 
 
569 aa  296  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  42.86 
 
 
335 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.09 
 
 
331 aa  287  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  45.32 
 
 
333 aa  287  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  44.86 
 
 
331 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.43 
 
 
332 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  41.69 
 
 
333 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.76 
 
 
333 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.41 
 
 
332 aa  281  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.57 
 
 
332 aa  278  3e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  43.67 
 
 
598 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.13 
 
 
332 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  43.73 
 
 
334 aa  274  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.2 
 
 
329 aa  272  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.2 
 
 
329 aa  272  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
341 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  42.77 
 
 
332 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.22 
 
 
332 aa  271  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  43.29 
 
 
334 aa  270  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4069  Glycerone kinase  46.11 
 
 
330 aa  270  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.41 
 
 
331 aa  269  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1572  dihydroxyacetone kinase family protein  46.73 
 
 
330 aa  268  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0152467  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  42.99 
 
 
619 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.61 
 
 
329 aa  265  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  44.58 
 
 
589 aa  265  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  41.93 
 
 
335 aa  264  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.39 
 
 
333 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  42.24 
 
 
333 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
333 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.09 
 
 
333 aa  260  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  43.98 
 
 
588 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  44.88 
 
 
612 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  40.54 
 
 
582 aa  258  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  42.04 
 
 
573 aa  258  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0620  Glycerone kinase  45.71 
 
 
336 aa  257  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3211  Glycerone kinase  40.66 
 
 
332 aa  256  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.99 
 
 
330 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.17 
 
 
331 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40 
 
 
327 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.58 
 
 
332 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.46 
 
 
331 aa  254  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  40.3 
 
 
327 aa  253  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  42.03 
 
 
362 aa  252  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3823  Glycerone kinase  44.86 
 
 
330 aa  252  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386942  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  42.03 
 
 
362 aa  252  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.48 
 
 
333 aa  251  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.66 
 
 
356 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.83 
 
 
369 aa  251  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  39.66 
 
 
356 aa  251  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.66 
 
 
356 aa  251  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.66 
 
 
356 aa  251  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  39.66 
 
 
356 aa  251  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  41.59 
 
 
333 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  43.12 
 
 
333 aa  251  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.39 
 
 
356 aa  250  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.66 
 
 
356 aa  250  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.48 
 
 
333 aa  249  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  39.64 
 
 
583 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  39.64 
 
 
583 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  41.59 
 
 
333 aa  249  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.5 
 
 
333 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.68 
 
 
355 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  39.64 
 
 
583 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  39.64 
 
 
583 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.09 
 
 
332 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  38.57 
 
 
616 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  40.98 
 
 
587 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.72 
 
 
329 aa  244  5e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.78 
 
 
354 aa  243  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0356  Glycerone kinase  44.34 
 
 
330 aa  243  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.11 
 
 
333 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.67 
 
 
322 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.67 
 
 
322 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.02 
 
 
364 aa  241  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.88 
 
 
320 aa  241  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  39.94 
 
 
583 aa  241  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1340  Glycerone kinase  41.52 
 
 
334 aa  240  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  39.94 
 
 
583 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3761  Dak kinase  42.55 
 
 
327 aa  240  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  39.94 
 
 
583 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  39.94 
 
 
583 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  39.64 
 
 
583 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.9 
 
 
333 aa  239  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.79 
 
 
333 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  39.94 
 
 
583 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.06 
 
 
325 aa  238  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.58 
 
 
329 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  39.64 
 
 
583 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.37 
 
 
330 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.09 
 
 
333 aa  237  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>