20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3784 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3784  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.575497 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6907  hypothetical protein  59.62 
 
 		 262 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364037 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5103  hypothetical protein  57.2 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3871  hypothetical protein  34.63 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3956  hypothetical protein  31.58 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3180  hypothetical protein  32.74 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_004310  BR1469  hypothetical protein  31.16 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3587  hypothetical protein  33.04 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1423  hypothetical protein  31.16 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1702  hypothetical protein  31.05 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00453742  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5771  hypothetical protein  42.59 
 
 		 176 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148222  normal  0.178418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2419  hypothetical protein  28.15 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147203  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3031  hypothetical protein  25.54 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5034  hypothetical protein  25.21 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0937  hypothetical protein  26.73 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1532  hypothetical protein  24.55 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0272744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2479  hypothetical protein  25.56 
 
 		 445 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1904  hypothetical protein  25.99 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.815763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2635  hypothetical protein  25.42 
 
 		 319 aa  45.4  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.406552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1240  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>