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for query gene Smed_3783 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  77.72 
 
 
199 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  70.41 
 
 
197 aa  290  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  54.69 
 
 
197 aa  211  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  54.95 
 
 
199 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
198 aa  203  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  52.11 
 
 
196 aa  187  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  46.11 
 
 
198 aa  187  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
195 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  47.15 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  47.94 
 
 
195 aa  175  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  52.3 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  52.87 
 
 
196 aa  171  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  47.94 
 
 
195 aa  171  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
201 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
201 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
202 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
198 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
209 aa  98.6  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 
205 aa  98.2  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  31.98 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  29.56 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  32.73 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 
310 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  25.73 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 
219 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
249 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 
209 aa  57.8  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 
307 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  31.36 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
253 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  30.28 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
261 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
236 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
236 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
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NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
228 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
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NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
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NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 
228 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
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NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
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NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 
203 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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