More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3764 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 917 aa  1852    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 927 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  50.5 
 
 		 970 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  48.92 
 
 		 998 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.07 
 
 		 977 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.52 
 
 		 796 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 858 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 		 798 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.83 
 
 		 791 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.4 
 
 		 803 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 991 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  45.4 
 
 		 792 aa  426  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.65 
 
 		 984 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 		 975 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.14 
 
 		 1022 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  40.15 
 
 		 910 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.05 
 
 		 974 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 1003 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 687 aa  356  7.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  40.65 
 
 		 1361 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 		 1362 aa  353  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 1271 aa  346  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 1172 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 1046 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 		 823 aa  312  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 		 1143 aa  298  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 755 aa  295  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  33.27 
 
 		 1158 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1195 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1216 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1169 aa  282  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 1356 aa  281  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  33.5 
 
 		 868 aa  281  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 		 633 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  35.35 
 
 		 1137 aa  279  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1954 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 1203 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 1839 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1137 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1168 aa  273  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1163 aa  273  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  31.3 
 
 		 786 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 		 1237 aa  270  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1159 aa  269  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1603 aa  269  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 1896 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 1352 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 2107 aa  267  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 849 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0025  histidine kinase  33.12 
 
 		 849 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1158 aa  266  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  52.87 
 
 		 575 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 1155 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1141 aa  265  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 1201 aa  264  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  34.7 
 
 		 1695 aa  264  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1611 aa  264  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 2099 aa  264  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 944 aa  264  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 1917 aa  263  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 		 395 aa  263  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.75 
 
 		 835 aa  261  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1782 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1155 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 1145 aa  260  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 574 aa  259  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  33.03 
 
 		 1200 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  31.34 
 
 		 1196 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 870 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 2099 aa  259  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 1310 aa  259  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1155 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 1064 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 1582 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 929 aa  258  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  38.74 
 
 		 982 aa  258  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 		 1771 aa  258  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 		 1767 aa  257  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1767 aa  257  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1765 aa  257  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.36 
 
 		 1763 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 1149 aa  255  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.36 
 
 		 386 aa  255  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 1193 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 1193 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 		 1767 aa  254  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 1165 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 		 1131 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1142 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 1275 aa  252  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1155 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1326 aa  252  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1680 aa  251  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 1713 aa  251  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 1936 aa  251  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 1768 aa  251  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1158 aa  251  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  34.9 
 
 		 539 aa  250  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 1313 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1267 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>