More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3742 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  59.66 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  54.82 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 238 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  31.31 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.22 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.13 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.77 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.4 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  34.45 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.1 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.38 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.64 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.71 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  32.48 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  33.97 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.72 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  32.89 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4351  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  30.41 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.92 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.91 
 
 		 228 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  38.51 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.14 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.64 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.82 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  35.2 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  36.36 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.94 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  35.15 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  32.09 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  29.41 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  32.19 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.84 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  27.5 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.12 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.12 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  31.7 
 
 		 237 aa  96.3  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  36.18 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 337 aa  95.1  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  32.35 
 
 		 254 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  36.18 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  32.35 
 
 		 254 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  32.35 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.17 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.19 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  33.5 
 
 		 229 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  26.5 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  29.78 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  25.87 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.22 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  25.87 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  31.25 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  32.11 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  26.54 
 
 		 229 aa  93.2  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  33.49 
 
 		 254 aa  92.8  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  29.73 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  34.16 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  34.16 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.16 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.16 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.16 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  34.16 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.16 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 218 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.16 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.95 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  25.87 
 
 		 218 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.16 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1150  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.48 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>