More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3618 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
421 aa  860    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.13 
 
 
438 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.53 
 
 
447 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.26 
 
 
434 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.7 
 
 
439 aa  471  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.72 
 
 
441 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.65 
 
 
433 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.81 
 
 
443 aa  464  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.2 
 
 
441 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.61 
 
 
427 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.61 
 
 
427 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.2 
 
 
441 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.88 
 
 
442 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.2 
 
 
441 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  53.05 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.7 
 
 
444 aa  458  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.2 
 
 
429 aa  455  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  53.48 
 
 
428 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.48 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.77 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  52.27 
 
 
438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  51.8 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.92 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.41 
 
 
431 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.05 
 
 
422 aa  448  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.68 
 
 
425 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.45 
 
 
449 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.66 
 
 
448 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.14 
 
 
706 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  53.92 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.94 
 
 
456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.74 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  51.93 
 
 
424 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  54.34 
 
 
426 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.16 
 
 
425 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.94 
 
 
439 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.01 
 
 
438 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.28 
 
 
434 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.67 
 
 
440 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.01 
 
 
438 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.7 
 
 
426 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  49.88 
 
 
602 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  51.56 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.77 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.73 
 
 
426 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.52 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.61 
 
 
454 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.22 
 
 
467 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.3 
 
 
438 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.47 
 
 
441 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  49.64 
 
 
438 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  52.29 
 
 
427 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.87 
 
 
439 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.67 
 
 
436 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  51.92 
 
 
422 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.03 
 
 
431 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.03 
 
 
431 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  51.92 
 
 
422 aa  431  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.67 
 
 
440 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.86 
 
 
425 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.23 
 
 
454 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.72 
 
 
438 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.85 
 
 
425 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  49.4 
 
 
594 aa  428  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  52.03 
 
 
431 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.33 
 
 
426 aa  428  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.2 
 
 
436 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3173  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.1 
 
 
446 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.44 
 
 
436 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.44 
 
 
436 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  47.95 
 
 
597 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.44 
 
 
436 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.2 
 
 
436 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.51 
 
 
458 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.2 
 
 
436 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.2 
 
 
436 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.28 
 
 
429 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.03 
 
 
431 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.2 
 
 
436 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.44 
 
 
436 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.2 
 
 
436 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.44 
 
 
436 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.2 
 
 
436 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  52.59 
 
 
427 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  52.59 
 
 
427 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  52.59 
 
 
427 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.21 
 
 
452 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.96 
 
 
442 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.96 
 
 
442 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.68 
 
 
444 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  49.4 
 
 
545 aa  426  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.64 
 
 
427 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  48.79 
 
 
539 aa  425  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.98 
 
 
452 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.85 
 
 
446 aa  425  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  47.71 
 
 
610 aa  425  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.72 
 
 
452 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.2 
 
 
436 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.63 
 
 
426 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  49.16 
 
 
545 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>