More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3601 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  80.61 
 
 		 501 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 508 aa  1008    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.64 
 
 		 501 aa  801    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 		 511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  57.78 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3776  L-arabinose transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 514 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.947339  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 		 503 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0138907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0590  L-arabinose transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 		 503 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164103  normal  0.0495673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3704  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.57 
 
 		 503 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0139  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 		 503 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0622  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 		 503 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0518663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3410  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.31 
 
 		 512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0659281  normal  0.140224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.11 
 
 		 516 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429295  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2763  L-arabinose transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 		 520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691602  normal  0.315971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2757  L-arabinose transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 		 511 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2614  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 504 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0523  L-arabinose transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 		 487 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1180  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 		 503 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0405  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1265  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3300  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3483  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 503 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3447  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 503 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 503 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  51.7 
 
 		 504 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 507 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  50.1 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  50.1 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.92 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 507 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  50.1 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.24 
 
 		 519 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.13 
 
 		 522 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.64 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.03 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.03 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.24 
 
 		 515 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  51.93 
 
 		 507 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.31 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.31 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 		 523 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4218  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.71 
 
 		 520 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  0.845406 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  51.93 
 
 		 515 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  51.32 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3009  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.51 
 
 		 509 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3961  L-arabinose transporter ATP-binding protein  51.32 
 
 		 515 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4140  L-arabinose transporter ATP-binding protein  51.32 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2599  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1020  L-arabinose transporter ATP-binding protein  49.09 
 
 		 497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  47.06 
 
 		 521 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.38 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  45.21 
 
 		 509 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.69 
 
 		 511 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.82 
 
 		 496 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  42.77 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 		 523 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  44.6 
 
 		 518 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  44.4 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.56 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  43.61 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.8 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.2 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  46.53 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.31 
 
 		 524 aa  412  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  45.84 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.99 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 		 494 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.71 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  43.99 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.04 
 
 		 514 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  43.61 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  43.99 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  44.38 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  43.47 
 
 		 524 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.04 
 
 		 514 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  43.82 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.04 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  44.04 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  44.04 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  43.61 
 
 		 500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  44.79 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  43.7 
 
 		 524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  43.79 
 
 		 513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.92 
 
 		 514 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  44.76 
 
 		 516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  43.84 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>