12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3548 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3548  SH3 domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  253  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3400  SH3 domain-containing protein  37.72 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3404  SH3 domain protein  36.04 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3074  hypothetical protein  35.09 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3378  SH3 domain protein  33.04 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2534  Variant SH3 domain protein  31.03 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3748  Variant SH3 domain protein  28.7 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3571  SH3 domain-containing protein  29.31 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541484  normal  0.671708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04226  variant SH3 domain protein  31.43 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00630  SH3 domain-containing protein  30.09 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0383  SH3 domain-containing protein  26.72 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0826  SH3 domain-containing protein  26.79 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.640875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>