More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3531 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  100 
 
 		 124 aa  248  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  78.49 
 
 		 120 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  76.34 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  66.99 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  60.55 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  68.48 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  66.3 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  66.3 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  46.22 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  58.59 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  52.54 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  53.92 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  53.39 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  53.39 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  66.25 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  56.7 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  62.79 
 
 		 199 aa  106  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 367 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  53.77 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  54.63 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  64.94 
 
 		 371 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  62.79 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  62.79 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  52.83 
 
 		 114 aa  104  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  59.3 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  62.79 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  58.43 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 324 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  58.14 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  53.77 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  52.04 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  57.47 
 
 		 211 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  52.99 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  55.95 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 342 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  55.81 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 358 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  59.3 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 171 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  54.29 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 360 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 360 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  59.3 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  55.81 
 
 		 242 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 		 211 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 		 230 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 		 211 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 		 230 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  55.81 
 
 		 242 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  59.3 
 
 		 171 aa  98.6  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 		 211 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 284 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  52.75 
 
 		 257 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  61.63 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  50 
 
 		 239 aa  97.1  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  56.04 
 
 		 182 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  47.96 
 
 		 213 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  55.81 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 214 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.49 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 129 aa  95.9  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0699  rare lipoprotein A  49.53 
 
 		 138 aa  95.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 270 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  55.81 
 
 		 175 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  52.83 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 199 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 196 aa  94.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 249 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  49.5 
 
 		 262 aa  94.4  5e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  48.57 
 
 		 335 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 221 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  53.49 
 
 		 285 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  48.72 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  54.02 
 
 		 238 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  53.49 
 
 		 243 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  51.65 
 
 		 286 aa  93.2  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 198 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  59.76 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>