226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3470 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  836    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  28.88 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  27.67 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  28.64 
 
 		 411 aa  147  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 417 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  28.12 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 418 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 447 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 474 aa  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  27.3 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  29.13 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  23.61 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  26.72 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 425 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 436 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  26.69 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  27.94 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 452 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  24.69 
 
 		 412 aa  119  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  28.72 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 408 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 418 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 418 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 418 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  31.08 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 726 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  26.34 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 446 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 446 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  32.25 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 446 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  26.56 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  24.79 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  26.59 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  24.33 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 436 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  23.28 
 
 		 407 aa  106  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  24.79 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  28.07 
 
 		 434 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  28.49 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  28.07 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  26.93 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  26.65 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  26.65 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  26.36 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  26.36 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  23.72 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  22.47 
 
 		 395 aa  99.8  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 713 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  25.14 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  28.49 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  25.56 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  23.44 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  25.07 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  24.72 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  26.32 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>