299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3438 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  79.08 
 
 		 201 aa  320  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  78.06 
 
 		 201 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  76.8 
 
 		 204 aa  288  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  59.9 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  56.93 
 
 		 219 aa  234  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  56.93 
 
 		 219 aa  234  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  63.58 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  49.02 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  54.87 
 
 		 286 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  54.92 
 
 		 201 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  58.38 
 
 		 238 aa  201  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  49.73 
 
 		 262 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  53.67 
 
 		 263 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  50.53 
 
 		 259 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  49.74 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  55.37 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  55.03 
 
 		 314 aa  193  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  55.49 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  54.91 
 
 		 251 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  54.91 
 
 		 251 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  50 
 
 		 255 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  53.93 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  51.96 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  45.99 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  45.05 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  48.21 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  45.03 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  46.24 
 
 		 196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  50.92 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  45.3 
 
 		 194 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  43.46 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  43.46 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  47.17 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  42.93 
 
 		 178 aa  131  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  42.94 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  44.44 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  41.62 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  44.31 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  41.78 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  38.26 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  37.75 
 
 		 153 aa  98.2  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  40.28 
 
 		 151 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  36.67 
 
 		 154 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  96.3  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  31.54 
 
 		 158 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  39.84 
 
 		 151 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  36.77 
 
 		 151 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  36.55 
 
 		 154 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  36.6 
 
 		 156 aa  92  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  34.33 
 
 		 165 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  33.56 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  36.81 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  36.84 
 
 		 159 aa  89.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  36.59 
 
 		 151 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  33.08 
 
 		 151 aa  88.6  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  38.66 
 
 		 154 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  38.66 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  32.62 
 
 		 152 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  38.66 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  38.66 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  38.66 
 
 		 154 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  35.07 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  33.78 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.2 
 
 		 153 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  36.97 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  34.01 
 
 		 154 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  37.4 
 
 		 151 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  37.3 
 
 		 152 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  37.4 
 
 		 151 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  33.83 
 
 		 152 aa  85.1  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  37.82 
 
 		 150 aa  84.7  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  37.82 
 
 		 150 aa  84.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  37.82 
 
 		 150 aa  84.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  36.97 
 
 		 162 aa  84.7  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  37.82 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  37.82 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  37.82 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  37.82 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  37.82 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  37.82 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  36.89 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  37.82 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  37.82 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  36.13 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  36.97 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  36.96 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  36.96 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  35.34 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  37.19 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  36.97 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  32.03 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  37.19 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  36.13 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  34.87 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.17 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>