More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3378 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  76.06 
 
 		 330 aa  534  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  76.67 
 
 		 330 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  76.36 
 
 		 330 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  70 
 
 		 330 aa  475  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  70 
 
 		 330 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  69.39 
 
 		 330 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  68.88 
 
 		 331 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  54.88 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  55.18 
 
 		 333 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  55.52 
 
 		 333 aa  349  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  54.57 
 
 		 333 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  55.05 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  54.83 
 
 		 337 aa  346  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  56.11 
 
 		 328 aa  345  8e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  54.88 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  54.27 
 
 		 333 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  55.18 
 
 		 333 aa  342  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  53.66 
 
 		 329 aa  335  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  51.81 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  54.63 
 
 		 333 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  51.81 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  52.41 
 
 		 337 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  51.55 
 
 		 338 aa  328  7e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  51.64 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  53.17 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  52.23 
 
 		 407 aa  322  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  52.73 
 
 		 338 aa  318  6e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  52.27 
 
 		 331 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  51.58 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  49.04 
 
 		 332 aa  308  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  50.94 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  50.32 
 
 		 337 aa  301  9e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  47.13 
 
 		 335 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  47.13 
 
 		 335 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  46.52 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  49.23 
 
 		 333 aa  288  9e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  51.91 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  49.2 
 
 		 331 aa  285  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  45.29 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  45.48 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  40.06 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  45.18 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  41.77 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  42.11 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  46.08 
 
 		 330 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  42.11 
 
 		 333 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  43.77 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  46.96 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  42.01 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  40.89 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  42.45 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  35.13 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  35.13 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.02 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  36.48 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  33.33 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.89 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.89 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  35.47 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  30.28 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  35.62 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 341 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  33.09 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  29.47 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  32 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  29.17 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  28.06 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.77 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.95 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.27 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  27.67 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.96 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.95 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.95 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.44 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  25.59 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  27.15 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.63 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.63 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  27.48 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.63 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  25.08 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  30.57 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  25.94 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  27.97 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.96 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  28.73 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.04 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  28.94 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.55 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  27.64 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  27.78 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>