More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3281 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 343 aa  703    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  50.74 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.3 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.3 
 
 		 341 aa  346  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  52.9 
 
 		 342 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  52.73 
 
 		 342 aa  342  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  51.8 
 
 		 340 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  49.4 
 
 		 341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  49.26 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  48.36 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  47.92 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  52.4 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  46.63 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  45 
 
 		 343 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  45 
 
 		 343 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  45.51 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  43.5 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  42.14 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  43.77 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  43.13 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  41.11 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  41.53 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  42.12 
 
 		 342 aa  235  7e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  38.56 
 
 		 350 aa  209  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  39.78 
 
 		 266 aa  190  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  36.73 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 340 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  34.83 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  34.83 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.74 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  34.75 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  34.3 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  33.68 
 
 		 340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  31.87 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  36.15 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  35.38 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.36 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.2 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  33.1 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.72 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.85 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  30.65 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.36 
 
 		 336 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  33.45 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4694  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.55 
 
 		 338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.5 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 351 aa  125  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  27.02 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  30.59 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.22 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  27.22 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  27.22 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.22 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.08 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.22 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  27.22 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.73 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.9 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.9 
 
 		 358 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  35.59 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  34.15 
 
 		 344 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  33.91 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  33.91 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  34.32 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3791  ABC transporter, substrate-binding protein  32.2 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  34.32 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  33.47 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  34.75 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  34.32 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  34.32 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  29.87 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  27.17 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  30.14 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4433  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  29.34 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  0.0000000026678 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2031  ABC-type transporter, periplasmic component  30.15 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.702659  hitchhiker  0.000664756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.42 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.42 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.42 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4734  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.42 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3629  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0752  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>