More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3244 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  72.5 
 
 
243 aa  358  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  70.83 
 
 
243 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  68.1 
 
 
237 aa  332  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  51.88 
 
 
239 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  51.5 
 
 
232 aa  234  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  51.48 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  51.29 
 
 
248 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  50.21 
 
 
243 aa  231  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  50.43 
 
 
240 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  50.85 
 
 
252 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  49.57 
 
 
257 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  49.15 
 
 
236 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  49.57 
 
 
245 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  48.12 
 
 
240 aa  222  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  49.15 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  51.9 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  49.35 
 
 
240 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  49.15 
 
 
250 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  48.51 
 
 
248 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  48.09 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  47.44 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  48.68 
 
 
240 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  47.88 
 
 
239 aa  208  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  47.23 
 
 
248 aa  208  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  47.3 
 
 
241 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  44.21 
 
 
253 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  46.75 
 
 
240 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  44.12 
 
 
252 aa  184  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  43.78 
 
 
227 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  42.8 
 
 
239 aa  171  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  41.3 
 
 
223 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  39.6 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  42.22 
 
 
237 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  36.56 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  37.28 
 
 
221 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  34.35 
 
 
226 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  35.83 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  36.86 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  36.86 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.63 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  35.37 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  33.63 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  36.44 
 
 
223 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  37.39 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  37.55 
 
 
222 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  35.17 
 
 
223 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  34.76 
 
 
222 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  34.18 
 
 
229 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  34.18 
 
 
229 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  35.24 
 
 
229 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 
223 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  34.91 
 
 
223 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  35.92 
 
 
239 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  34.19 
 
 
224 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  34.19 
 
 
224 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  31.84 
 
 
232 aa  99.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  34.47 
 
 
222 aa  99  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  31.93 
 
 
240 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  32.91 
 
 
223 aa  98.6  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  36.8 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  34.69 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  35.78 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  35 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  32.35 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  34.27 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  35.22 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  34.69 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  34.69 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  32.31 
 
 
237 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  33.88 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
228 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  32.3 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  33.88 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  33.88 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  33.88 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
225 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  34.44 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  33.88 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  31.98 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  33.88 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  41.67 
 
 
324 aa  92.4  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  32.77 
 
 
222 aa  92  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  34.03 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  31.8 
 
 
239 aa  91.7  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 
581 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  34.4 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  32.89 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  32.16 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  33.18 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  31.54 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  33.2 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  33.48 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  31.03 
 
 
311 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>