286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3235 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  64.54 
 
 		 252 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  63.75 
 
 		 252 aa  332  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  61.34 
 
 		 254 aa  311  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  53.15 
 
 		 253 aa  264  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  53.15 
 
 		 255 aa  264  8.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  52.8 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  53.91 
 
 		 253 aa  251  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  44.3 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  46.36 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  42.39 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  40.51 
 
 		 244 aa  188  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  42.04 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  41.06 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  42.86 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  44.93 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  44.71 
 
 		 278 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  44.44 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  42.51 
 
 		 247 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  41.46 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  41.04 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  40.87 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  39.38 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  38.62 
 
 		 279 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  42.93 
 
 		 198 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  39.46 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  39.22 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  39.32 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  35.74 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  38.94 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  37.22 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  35.75 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  36.49 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  37.23 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  27.85 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  36.4 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  31 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  29.79 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  32.91 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  31.94 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  34.82 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.2 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  29.3 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  29.41 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  29.41 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  29.6 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  27.97 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  28.93 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  29.71 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.98 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  26.14 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  31.39 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  28.94 
 
 		 316 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  28.57 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  26.42 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  29.11 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  28.87 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  27.75 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.51 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  29.82 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  29.82 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  24.58 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  26.69 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  26.69 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  26.69 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  26.69 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  26.69 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  26.69 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  26.69 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  31.11 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  27.44 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  26.58 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  26.75 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  28.9 
 
 		 288 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  41.12 
 
 		 224 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  29.31 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  27.78 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  29.57 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.68 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  32.28 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  26.37 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  27.85 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  26.32 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  31.51 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  35.77 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  26.92 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  25.74 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  29.24 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  27.27 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  28.38 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  25.37 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  24.88 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  25.13 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  28.43 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  26.84 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  29.22 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  28.45 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  24.88 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>