More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3167 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  100 
 
 		 370 aa  753    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  81.72 
 
 		 371 aa  624  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  81.08 
 
 		 371 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  80.86 
 
 		 371 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  80.05 
 
 		 371 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  79.78 
 
 		 371 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  78.76 
 
 		 354 aa  589  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  61.73 
 
 		 371 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  60.11 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  55.83 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  57.53 
 
 		 365 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  55.05 
 
 		 376 aa  408  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  54.93 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  54.26 
 
 		 371 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.23 
 
 		 372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  54.57 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  54.57 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  55.5 
 
 		 372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  54.69 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  54.69 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  54.69 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  54.57 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  53.49 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.96 
 
 		 371 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  56.27 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.96 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  52.38 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  53.64 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.08 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  52.13 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  52.56 
 
 		 384 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.08 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  52.82 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.74 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  52.29 
 
 		 384 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  51.08 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  54.64 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  55.07 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  51.99 
 
 		 384 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  53.37 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  51.34 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  54.3 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  51.61 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.13 
 
 		 367 aa  371  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.4 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  51.08 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  53.48 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  52.85 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  51.34 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  51.89 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  52.16 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  51.48 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  52.16 
 
 		 354 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  49.73 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.16 
 
 		 369 aa  358  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  50 
 
 		 355 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  50.13 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  47.45 
 
 		 367 aa  355  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  53.37 
 
 		 357 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.2 
 
 		 370 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  48.01 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.92 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  51.48 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  49.45 
 
 		 367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.55 
 
 		 367 aa  352  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.55 
 
 		 367 aa  352  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50.81 
 
 		 353 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.13 
 
 		 365 aa  352  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  49.19 
 
 		 352 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.38 
 
 		 365 aa  348  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  49.6 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  49.34 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 366 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  50 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  47.37 
 
 		 366 aa  346  4e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  48.65 
 
 		 353 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  46.11 
 
 		 366 aa  345  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  48.25 
 
 		 353 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.86 
 
 		 370 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.63 
 
 		 372 aa  343  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.63 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  46.19 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>