244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3134 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  100 
 
 		 396 aa  776    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  68.43 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  70.45 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  60.47 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  58.67 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  59.05 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  49.33 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  38.06 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 441 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 400 aa  189  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  37.93 
 
 		 383 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  36.93 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  36.96 
 
 		 383 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 381 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 373 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  36.41 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  35.67 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  35.67 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  35.67 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  35.67 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  35.67 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  35.67 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 393 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  35.39 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 403 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 391 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  33.77 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 386 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 369 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  31.13 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  32.69 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  39.6 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 404 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 404 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 373 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 407 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  35.45 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  31.58 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  31.79 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.42 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  33.68 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 387 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.98 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  32.6 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>