More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3077 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  67.57 
 
 
200 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  63.78 
 
 
185 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  63.04 
 
 
209 aa  241  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  55.29 
 
 
180 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  50.82 
 
 
186 aa  185  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  54.86 
 
 
186 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.522089 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  54.86 
 
 
186 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4669  GCN5-related N-acetyltransferase  54.86 
 
 
186 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  55.23 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  55.81 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  56.07 
 
 
176 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  55.23 
 
 
186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  54.49 
 
 
205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  52.57 
 
 
185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  54.65 
 
 
179 aa  181  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  54.71 
 
 
181 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  56.47 
 
 
174 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3321  phosphinothricin N-acetyltransferase  51.15 
 
 
179 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0173112  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.14 
 
 
247 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.14 
 
 
247 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  53.76 
 
 
186 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.14 
 
 
247 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4882  GCN5-related N-acetyltransferase  51.76 
 
 
197 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256707  normal  0.880249 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1014  phosphinothricin N-acetyltransferase  52.57 
 
 
188 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1301  phosphinothricin N-acetyltransferase  52.57 
 
 
210 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0284  phosphinothricin N-acetyltransferase  52.57 
 
 
247 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0554  phosphinothricin N-acetyltransferase  52.57 
 
 
247 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450037  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  52.33 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4517  GCN5-related N-acetyltransferase  51.72 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.729154  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  51.18 
 
 
188 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00313605  hitchhiker  0.0000000000000200087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1467  phosphinothricin N-acetyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  51.16 
 
 
210 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  51.18 
 
 
200 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5346  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
174 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  48.24 
 
 
179 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  49.13 
 
 
206 aa  167  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  51.74 
 
 
176 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2931  Phosphinothricin acetyltransferase  46.59 
 
 
178 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  49.14 
 
 
184 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1103  putative phosphinothricin acetyltransferase  50.29 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1606  GCN5-related N-acetyltransferase  47.93 
 
 
180 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0984019  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6053  GCN5-related N-acetyltransferase  50.91 
 
 
180 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134247  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  51.46 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00885  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.41 
 
 
179 aa  160  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  49.08 
 
 
182 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1356  GCN5-related N-acetyltransferase  48.85 
 
 
181 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.181273  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2733  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 
184 aa  157  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
182 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
182 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  50.62 
 
 
177 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  46.55 
 
 
195 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0345136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  46.86 
 
 
176 aa  153  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  50.59 
 
 
186 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1689  GCN5-related N-acetyltransferase  45.29 
 
 
178 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
197 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3122  Phosphinothricin acetyltransferase  44.51 
 
 
176 aa  151  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  45.88 
 
 
173 aa  151  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 
167 aa  150  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0856381  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  47.24 
 
 
173 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  45.56 
 
 
226 aa  148  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0397  phosphinothricin acetyltransferase protein  48.17 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456114  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1472  Phosphinothricin acetyltransferase  46.55 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1401  GCN5-related N-acetyltransferase  42.94 
 
 
174 aa  140  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  41.52 
 
 
193 aa  140  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64360  hypothetical protein  45.45 
 
 
172 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272704  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5587  hypothetical protein  43.93 
 
 
172 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  43.56 
 
 
170 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  42.68 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
169 aa  127  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  0.335188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4892  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  41.07 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4064  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
169 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0992  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 
191 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2407  GCN5-related N-acetyltransferase  41.11 
 
 
195 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
185 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0583  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2342  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4403  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
192 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0955  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  43.71 
 
 
176 aa  118  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0390446  decreased coverage  0.000407903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4846  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  42.24 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6404  GCN5-related N-acetyltransferase  38.01 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.507549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4903  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449893  hitchhiker  0.00644876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1342  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  37.89 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.952982  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5129  GCN5-related N-acetyltransferase  38.15 
 
 
175 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3378  acetyltransferase  37.06 
 
 
180 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2224  Phosphinothricin acetyltransferase  39.64 
 
 
198 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3655  Phosphinothricin acetyltransferase  38.46 
 
 
168 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  40.99 
 
 
171 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1335  sortase related acyltransferase  36.42 
 
 
177 aa  114  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000322304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3131  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  36.26 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1500  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0702354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>