More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3065 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  89.77 
 
 		 264 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  87.5 
 
 		 264 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  76.81 
 
 		 264 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  76.05 
 
 		 264 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  75.67 
 
 		 264 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  66.42 
 
 		 265 aa  345  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  61.74 
 
 		 264 aa  331  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  61.74 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  60.98 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  60.98 
 
 		 264 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  60.84 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 264 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  60.23 
 
 		 264 aa  321  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  60.23 
 
 		 264 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  60.23 
 
 		 264 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  60.23 
 
 		 264 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  59.85 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  60.23 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  59.09 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  59.09 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  58.33 
 
 		 264 aa  311  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  60.84 
 
 		 264 aa  311  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  59.09 
 
 		 264 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  61.36 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  58.71 
 
 		 264 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  60.98 
 
 		 264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  57.41 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  59.09 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  58.71 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  62.36 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  56.27 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  56.06 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  62.04 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  60.98 
 
 		 264 aa  292  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  53.38 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  48.86 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  51.33 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  50.19 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  49.05 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  49.62 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  44.7 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  44.49 
 
 		 265 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 267 aa  254  7e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  48.86 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  49.03 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  45.25 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 		 267 aa  240  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  50.4 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  47.31 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  50.76 
 
 		 263 aa  235  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  44.7 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  46.01 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  46.59 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  48.79 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  46.04 
 
 		 296 aa  228  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 261 aa  224  9e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  39.44 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  39.52 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  38.98 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.73 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.89 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.57 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  39.27 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  37.89 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2498  ABC transporter component  35.71 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.497129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  33.05 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  32.26 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  33.59 
 
 		 358 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  28.99 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  33.91 
 
 		 229 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  30.04 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.52 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  35.85 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  34.12 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.62 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  32.2 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  33.98 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  33.98 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2418  ABC transporter, transmembrane region, type 1  39.44 
 
 		 579 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0870797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>