More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2974 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 		 199 aa  410  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  85.23 
 
 		 178 aa  322  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  88.14 
 
 		 178 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  87.5 
 
 		 177 aa  317  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0988  inorganic pyrophosphatase  82.39 
 
 		 176 aa  310  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1993  inorganic pyrophosphatase  81.82 
 
 		 176 aa  310  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1919  inorganic pyrophosphatase  81.82 
 
 		 176 aa  310  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  81.82 
 
 		 177 aa  303  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  75 
 
 		 177 aa  291  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2664  inorganic pyrophosphatase  75.14 
 
 		 178 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00365311  normal  0.143617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  73.45 
 
 		 179 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  73.45 
 
 		 179 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  71.75 
 
 		 181 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  72.88 
 
 		 177 aa  280  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0268  inorganic pyrophosphatase  71.75 
 
 		 178 aa  278  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0106  inorganic pyrophosphatase  72.32 
 
 		 178 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2496  inorganic pyrophosphatase  73.3 
 
 		 180 aa  277  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81481  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0696  inorganic pyrophosphatase  72.88 
 
 		 178 aa  277  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  72.41 
 
 		 176 aa  275  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0040  inorganic pyrophosphatase  72.09 
 
 		 181 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  68.75 
 
 		 179 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0415  inorganic pyrophosphatase  71.19 
 
 		 178 aa  270  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  71.84 
 
 		 176 aa  269  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0583  inorganic diphosphatase  67.23 
 
 		 177 aa  268  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.297464 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0329  inorganic pyrophosphatase  68 
 
 		 177 aa  264  7e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  68.39 
 
 		 176 aa  254  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0303  inorganic diphosphatase  66.29 
 
 		 175 aa  251  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.710339  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3057  inorganic diphosphatase  60.34 
 
 		 178 aa  230  9e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  60 
 
 		 178 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0292  inorganic diphosphatase  57.63 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  55.17 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2532  inorganic diphosphatase  55.93 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  55.75 
 
 		 175 aa  208  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  55.75 
 
 		 175 aa  208  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  54.55 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  55.75 
 
 		 175 aa  208  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  56.4 
 
 		 176 aa  206  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  54.02 
 
 		 175 aa  205  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  54.55 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0146  inorganic pyrophosphatase  53.67 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  53.67 
 
 		 182 aa  204  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  54.65 
 
 		 176 aa  204  8e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  54.02 
 
 		 175 aa  203  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2123  inorganic pyrophosphatase  51.7 
 
 		 176 aa  202  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  53.98 
 
 		 177 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0029  inorganic pyrophosphatase  54.07 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360391  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0791  Inorganic diphosphatase  55.68 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  54.6 
 
 		 175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  52.84 
 
 		 176 aa  198  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3572  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 		 176 aa  198  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  55.29 
 
 		 175 aa  197  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  51.96 
 
 		 182 aa  197  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3413  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 		 176 aa  197  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2005  inorganic diphosphatase  52.27 
 
 		 176 aa  197  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0775435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0538  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 		 175 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0590  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 		 175 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0577  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 		 175 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.255065  normal  0.754426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0583  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 		 175 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001690  inorganic pyrophosphatase  51.14 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  52.91 
 
 		 173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  51.16 
 
 		 175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  52.91 
 
 		 173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  51.46 
 
 		 176 aa  195  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  52.81 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  53.53 
 
 		 175 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 		 175 aa  194  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00784  inorganic pyrophosphatase  50 
 
 		 182 aa  194  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  52.02 
 
 		 174 aa  194  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1074  inorganic pyrophosphatase  53.53 
 
 		 175 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11690  inorganic pyrophosphatase  53.53 
 
 		 175 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  52.3 
 
 		 175 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  51.72 
 
 		 175 aa  193  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  50 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4996  inorganic pyrophosphatase  51.15 
 
 		 175 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0462  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 		 176 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.807275 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  50 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  51.72 
 
 		 174 aa  191  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  49.43 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  49.43 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  49.15 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  57.32 
 
 		 171 aa  190  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  49.15 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  51.98 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1198  inorganic pyrophosphatase  51.72 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  51.16 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0742  inorganic diphosphatase  54.07 
 
 		 176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2358  Inorganic diphosphatase  50.57 
 
 		 175 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>