68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2920 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 367 aa  755    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  75.41 
 
 		 367 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  74.93 
 
 		 367 aa  570  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  72.19 
 
 		 373 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  68.07 
 
 		 392 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  58.15 
 
 		 379 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  52.97 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  55.34 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  53.82 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  53.91 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  53.54 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  52.97 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  52.41 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  52.12 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  52.12 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  52.97 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  52.97 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  52.97 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  52.41 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  52.41 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  52.41 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  52.97 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  51.73 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  52.12 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  52.12 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  50.99 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  50.28 
 
 		 373 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  50.99 
 
 		 389 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  50.4 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  49.72 
 
 		 376 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  47.51 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  47.51 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  45.81 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  45.66 
 
 		 376 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  45.86 
 
 		 385 aa  318  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  41.44 
 
 		 354 aa  295  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  38.55 
 
 		 354 aa  279  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  40.62 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  40.62 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  30.91 
 
 		 392 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  33.46 
 
 		 413 aa  136  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  31.49 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  29.75 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  29.72 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  28.11 
 
 		 347 aa  99.4  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  26.37 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  29.32 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  23.94 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  26.23 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  29.45 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  28.83 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  28.22 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  35.07 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  28.08 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  23.42 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  20 
 
 		 934 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  20.74 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  21.7 
 
 		 748 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  24.48 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  25.11 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  20.2 
 
 		 444 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  34.78 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  23.89 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  27.22 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  27.5 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  27.4 
 
 		 350 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  25.31 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>