More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2843 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3947  GntR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  45.22 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  27.16 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.39 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  24.7 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.7 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  25.22 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1363  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  22.84 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1337  GntR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.617468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.92 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  21.65 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  23.58 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  26.7 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.99 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  27.78 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2625  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0476677  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  26.45 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  28.15 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  24.24 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  23.38 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  24.12 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  25.43 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>