182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2824 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  310  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  63.64 
 
 		 125 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  64.41 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  55.96 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  53.33 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  53.33 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 115 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  53.92 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  53.92 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  55.77 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  53.33 
 
 		 177 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  45.1 
 
 		 115 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  63.1 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 107 aa  84  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  48.28 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  40.82 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  40.22 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  64.62 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  39.77 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  43.96 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  50.48 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  39.36 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  51.85 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  41.86 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  41.77 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  41.77 
 
 		 263 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  43.04 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  38.96 
 
 		 263 aa  67  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  33.98 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  34.51 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  44.71 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  41.56 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  31.91 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  48.05 
 
 		 265 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  32.47 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  31.46 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  34.65 
 
 		 266 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  44.44 
 
 		 269 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  39.22 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  39.18 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  44.87 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  31.17 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  44.87 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  40.86 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  46.75 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  37.74 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  34.83 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.36 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  30 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  46.75 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  43.18 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 268 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.15 
 
 		 265 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  46.15 
 
 		 265 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 263 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  38.71 
 
 		 254 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  38.1 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  31.17 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  39.81 
 
 		 278 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  38.82 
 
 		 269 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 236 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>