132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2814 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  57.56 
 
 		 265 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  52.67 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  57.25 
 
 		 256 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  52.67 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  53.57 
 
 		 253 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  54 
 
 		 271 aa  241  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  58.33 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  55.16 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  55.42 
 
 		 287 aa  231  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  55.69 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  48.8 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  50 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  55.65 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  48.45 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  47.6 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  51.58 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  48.78 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  48.68 
 
 		 253 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  47.11 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  54.3 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  53.85 
 
 		 247 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  47.44 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  53.39 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  50 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  44.66 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  46.22 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  45.58 
 
 		 249 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  49.59 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  51.27 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  52.92 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  39.36 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  46.67 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  46.67 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  45.61 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  48.36 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  44.63 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  49.75 
 
 		 230 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  43.29 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  47.75 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  42.62 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  47.13 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  47.03 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  42.42 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  42.62 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  45.05 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  48.85 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  49.17 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  44.34 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  42.34 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  44.34 
 
 		 242 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  43.7 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  43.89 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  42.32 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  42.32 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  42.68 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  42.34 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  40.98 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  40.57 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  42.74 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  40.16 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 		 245 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  41.59 
 
 		 250 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  41.42 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  41.91 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  42.86 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  43.15 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  42.86 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  42.86 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  41.2 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  43.44 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  42.11 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  42.92 
 
 		 239 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  35.27 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  41.37 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  43.69 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  43.5 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  40.42 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  41.89 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  26.78 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  24.67 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  25 
 
 		 655 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  27.56 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  28.21 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  28.88 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  27.56 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  27.62 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  30.93 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  27.47 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  23 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  30 
 
 		 602 aa  62.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  25 
 
 		 245 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>