More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2756 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 406 aa  835    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  55.75 
 
 		 405 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  55.19 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  52.9 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  47.49 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  37.27 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  32.49 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  35.09 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  31.28 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  36.14 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  35.33 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.33 
 
 		 466 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 		 494 aa  189  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  31.09 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.59 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  31.96 
 
 		 416 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  30.03 
 
 		 348 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  30.79 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  31.96 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  34.23 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  31 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.69 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  31.5 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  30.61 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  40.77 
 
 		 367 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  28.43 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  41.12 
 
 		 370 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 		 406 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.03 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 		 859 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.78 
 
 		 860 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  38.67 
 
 		 632 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  36.63 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  36.63 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  36.63 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  28.38 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  35.26 
 
 		 746 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 		 858 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 		 591 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.19 
 
 		 585 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 699 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 		 741 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.29 
 
 		 672 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 		 536 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  31.64 
 
 		 636 aa  94.4  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  27.84 
 
 		 701 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.78 
 
 		 861 aa  94.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.67 
 
 		 656 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  32.62 
 
 		 632 aa  93.6  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 		 532 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  28.83 
 
 		 358 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 		 758 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.42 
 
 		 696 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  34.46 
 
 		 864 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.83 
 
 		 614 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 		 903 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 		 740 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  34.86 
 
 		 549 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  29.38 
 
 		 701 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  32.77 
 
 		 564 aa  90.9  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.45 
 
 		 641 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  27.46 
 
 		 638 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.11 
 
 		 650 aa  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  35.66 
 
 		 464 aa  89.7  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  35.86 
 
 		 665 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.67 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  29.56 
 
 		 651 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  31.72 
 
 		 971 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 		 1805 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.9 
 
 		 607 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  32.12 
 
 		 735 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  29.91 
 
 		 667 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  31.94 
 
 		 645 aa  86.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 		 645 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.79 
 
 		 577 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 		 911 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  27.41 
 
 		 1119 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.17 
 
 		 678 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  31.18 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.24 
 
 		 584 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  25.6 
 
 		 731 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  35.44 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.69 
 
 		 584 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  31.45 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.12 
 
 		 652 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>