More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2735 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  100 
 
 		 344 aa  692    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  81.1 
 
 		 344 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  80.52 
 
 		 344 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  79.82 
 
 		 345 aa  567  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  82.46 
 
 		 345 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  81.29 
 
 		 345 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  81.58 
 
 		 345 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  78.65 
 
 		 349 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  80.99 
 
 		 345 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  80.99 
 
 		 345 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  80.99 
 
 		 345 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  74.42 
 
 		 344 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  75.29 
 
 		 344 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  74.42 
 
 		 344 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  72.09 
 
 		 343 aa  501  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  71.64 
 
 		 342 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  71.35 
 
 		 342 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  71.35 
 
 		 342 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  71.8 
 
 		 341 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  70.64 
 
 		 341 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  72.97 
 
 		 343 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  70.76 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  65.31 
 
 		 344 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  68.71 
 
 		 342 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  64.12 
 
 		 340 aa  464  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  62.76 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  62.68 
 
 		 344 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  60.7 
 
 		 343 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  60.35 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  62.39 
 
 		 389 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  62.39 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  60 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  57.18 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  57.97 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  56.84 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  53.05 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  55.62 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  55.02 
 
 		 352 aa  342  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  48.83 
 
 		 355 aa  329  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  49.41 
 
 		 359 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  48.63 
 
 		 352 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  48.33 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  45.73 
 
 		 351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  46.49 
 
 		 350 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  44.57 
 
 		 357 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  45.16 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  48.64 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  45.16 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  45.83 
 
 		 349 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  45.02 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  45.54 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  46.71 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 348 aa  282  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 349 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  44.35 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  44.19 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  46.85 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  43.27 
 
 		 346 aa  271  8.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  42.65 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  42.65 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  40.76 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  44.22 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  41.89 
 
 		 349 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  41.89 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  44.84 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  43.68 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  44.84 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  44.8 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  41.76 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  45.02 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  41.92 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  41.76 
 
 		 345 aa  255  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  45.13 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  42.18 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  43.93 
 
 		 322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  41.89 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  41.79 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.2 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 313 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  43.2 
 
 		 339 aa  248  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  43.62 
 
 		 344 aa  246  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  41.25 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  41.43 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.57 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  41.32 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  39.56 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  40.75 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  39.02 
 
 		 349 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  41.3 
 
 		 326 aa  235  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.86 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  41.84 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  40.81 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  41.59 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  39.27 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>