120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2603 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  194  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  69.23 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  67.03 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  56.04 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  53.85 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  52.75 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  48.42 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  52.22 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  50.56 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  48.31 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  51.39 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  40.22 
 
 		 377 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  42.39 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  39.24 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  36.14 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580402  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  36.71 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0096  hypothetical protein  35.16 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  34.41 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  43.28 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0075  hypothetical protein  37.36 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  38.04 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  38.95 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2928  acetyltransferase-like protein  36.96 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  37.65 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3705  hypothetical protein  38.24 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1740  hypothetical protein  39.13 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03998  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  34.29 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3865  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4368  hypothetical protein  34.29 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.337013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4681  hypothetical protein  34.29 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3900  hypothetical protein  34.29 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4595  hypothetical protein  34.29 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5642  hypothetical protein  34.29 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03959  hypothetical protein  34.29 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  35.8 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  33.72 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  34.41 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  34.57 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  38.27 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3304  hypothetical protein  36.62 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  34.09 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  36.23 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  35.38 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  36.23 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  36.23 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  34.21 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  35.38 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  36.23 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  32.94 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4180  acetyltransferase-like protein  37.23 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  35.06 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2544  acetyltransferase-like protein  37.14 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0495517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2596  hypothetical protein  37.14 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  31.4 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  39.74 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  27.06 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  32.26 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  29.21 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  36.71 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  30.86 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  31.11 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03020  predicted acetyltransferase  36.36 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09658  Acetyltransferase  31.46 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  34.78 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  32.88 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  32.35 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  31.87 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  33.72 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  38 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  24.18 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  37.25 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  40.48 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  26.67 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  25.58 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4571  acetyltransferase-like protein  30.85 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017414  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  35.29 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  30.86 
 
 		 123 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  28.57 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  29.17 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  31.76 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  26.58 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  30.43 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  33.77 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  37.74 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  28.21 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  28.21 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  25.97 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  27.91 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  26.92 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  28.75 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>