93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2597 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 299 aa  610  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  53.6 
 
 		 298 aa  305  7e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  56.25 
 
 		 255 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  57.87 
 
 		 257 aa  295  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  53.31 
 
 		 259 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  52.29 
 
 		 299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  51.41 
 
 		 293 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  50.58 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  46.62 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  46.09 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.34 
 
 		 304 aa  251  7e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  39.3 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  39.3 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  43.14 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  40.32 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  39.13 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  41.63 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  26.52 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  26.48 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  24.77 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.45 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  27.09 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  26.27 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  27.84 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  25.28 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  27.45 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.64 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.38 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  24.06 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  25.38 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  26.18 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  27.23 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  26.51 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  25.7 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  26.84 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.87 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  23.13 
 
 		 265 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  26.16 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  25.49 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  25.49 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  25.49 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.54 
 
 		 362 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  24.72 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  23.42 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.22 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  24.42 
 
 		 383 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  21.09 
 
 		 338 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 		 243 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  26.32 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  25.35 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  27.95 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.08 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  28.26 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.01 
 
 		 385 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  24.41 
 
 		 371 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  19.75 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  26.86 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  26.22 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  24.07 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  23.61 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  29.89 
 
 		 364 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 352 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  24.31 
 
 		 320 aa  45.8  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  24.88 
 
 		 361 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1362  metal-dependent hydrolase  25.53 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  22.76 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  23.6 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  23.18 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.74 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  28.17 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  25.11 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  23.47 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  23.18 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  21.48 
 
 		 396 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.6 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.32 
 
 		 590 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.71 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  26.32 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  22.73 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  22.6 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.29 
 
 		 374 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  23.78 
 
 		 367 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  31.71 
 
 		 344 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.68 
 
 		 353 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  21.09 
 
 		 227 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  21.31 
 
 		 356 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>