113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2557 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  70.62 
 
 		 211 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  70.62 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  65.71 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  54.36 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  53.85 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  53.33 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  48.76 
 
 		 220 aa  184  9e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  55.44 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  50.79 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  48.53 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  45.54 
 
 		 189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  47.2 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  48.35 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  42.44 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  45.54 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  46.19 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  45.13 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  44.62 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  36.16 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  37.05 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  37.61 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  36.89 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  35.87 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  37.61 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  37.61 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  34.82 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  36.44 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  37.61 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  37.61 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  37.61 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  37.61 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  37.61 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  37.61 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  37.78 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  36.44 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  34.86 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  36.44 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  36.44 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  34.68 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  35.59 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  33.63 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  33.63 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  33.63 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  33.63 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  36.44 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  36.44 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  37.27 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  37.16 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  36.49 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  34.98 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  35.41 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  35.41 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  35.41 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  33.49 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  35.98 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  38.5 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  36.28 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  34.88 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  33.49 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  32.77 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  33.49 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  33.49 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  33.49 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  34.7 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  33.97 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  33.97 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  36.24 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  36.7 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  31.25 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  30.77 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  31.29 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  28.4 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  34.96 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  30.34 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  30.34 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  30.34 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  28.68 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  26.43 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  26.92 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  25.9 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  25.15 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  25.85 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  25.85 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  24.53 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  24.14 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  24.7 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  26.56 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  28.83 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  29.13 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  31.09 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  26.19 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  27.59 
 
 		 262 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0523  hypothetical protein  25.56 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  26.38 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>