More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2351 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  100 
 
 		 528 aa  1074    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  69.51 
 
 		 527 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  69.51 
 
 		 527 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  61.48 
 
 		 526 aa  658    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  63.57 
 
 		 529 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  55.79 
 
 		 523 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  52.94 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  42.96 
 
 		 545 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  42.96 
 
 		 545 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  42.78 
 
 		 545 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  43.53 
 
 		 545 aa  442  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  41.68 
 
 		 538 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  45.52 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  42.37 
 
 		 542 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  41.32 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  41.32 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  43.89 
 
 		 543 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  42.37 
 
 		 526 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  42.41 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  42.72 
 
 		 528 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  42.86 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  41.62 
 
 		 547 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  40.89 
 
 		 543 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  42.29 
 
 		 544 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  41.68 
 
 		 544 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  40.79 
 
 		 544 aa  362  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  41.34 
 
 		 545 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  39.89 
 
 		 544 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  40.57 
 
 		 480 aa  319  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  37.64 
 
 		 603 aa  318  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  37.14 
 
 		 621 aa  312  9e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  38.02 
 
 		 758 aa  304  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  34.27 
 
 		 541 aa  242  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  30.89 
 
 		 502 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.81 
 
 		 497 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  31.6 
 
 		 524 aa  200  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  30.8 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  29.14 
 
 		 501 aa  173  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.05 
 
 		 503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  26.47 
 
 		 536 aa  154  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  27.87 
 
 		 438 aa  154  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  23.84 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  23.84 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  30.61 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.42 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  27.09 
 
 		 510 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  29.56 
 
 		 548 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.62 
 
 		 506 aa  139  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  27.69 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  26.13 
 
 		 505 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  29.44 
 
 		 562 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  25.42 
 
 		 495 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  23.33 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  28.84 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  23.33 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  28.32 
 
 		 562 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  25.13 
 
 		 556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  28.81 
 
 		 585 aa  128  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  24.75 
 
 		 494 aa  127  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.89 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  27.11 
 
 		 564 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  26.25 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  23.76 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  26.58 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  24.63 
 
 		 506 aa  123  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.14 
 
 		 497 aa  123  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.26 
 
 		 514 aa  123  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  27.63 
 
 		 506 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  28.95 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  26.62 
 
 		 509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  24.35 
 
 		 494 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  20.53 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.15 
 
 		 509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  21.67 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  24.82 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  25.52 
 
 		 505 aa  120  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.05 
 
 		 501 aa  120  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  25.18 
 
 		 506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  23.09 
 
 		 509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  22.12 
 
 		 502 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  24.68 
 
 		 500 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  22.77 
 
 		 494 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.62 
 
 		 499 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  24.36 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  25.67 
 
 		 549 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  28.42 
 
 		 567 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  25.47 
 
 		 495 aa  114  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  26.46 
 
 		 508 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  26.33 
 
 		 493 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  25.1 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  28.92 
 
 		 598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  24.91 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  27.08 
 
 		 564 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  27.1 
 
 		 520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  25.19 
 
 		 501 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  29.62 
 
 		 572 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  27.42 
 
 		 554 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  28.73 
 
 		 551 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  23.91 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  27.36 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.54265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>