20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2312 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  825    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  50.26 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  49.22 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  44.64 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  44.71 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  41.14 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  34.31 
 
 		 482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  32.28 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  32.97 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  32.27 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  31.08 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  30.6 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  30.24 
 
 		 363 aa  155  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  29.88 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  28.95 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  28.95 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  24.79 
 
 		 541 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07098  hypothetical protein  44.34 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  23.9 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  23.39 
 
 		 930 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>