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for query gene Smed_2205 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
202 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  72.63 
 
 
206 aa  293  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  71.51 
 
 
194 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  70.41 
 
 
209 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
200 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
202 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 
179 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
222 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
203 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
202 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
214 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  35.16 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 
189 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
189 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.22 
 
 
185 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 
191 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  34.05 
 
 
185 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 
189 aa  94.4  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 
218 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
184 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
196 aa  92  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
202 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
216 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 
213 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 
213 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
210 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
234 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  33.55 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
257 aa  81.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
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NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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