223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2184 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  69.57 
 
 		 667 aa  961    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  68.97 
 
 		 667 aa  956    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  100 
 
 		 665 aa  1372    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  49.17 
 
 		 650 aa  634  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  41.19 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  42.28 
 
 		 679 aa  534  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  41.28 
 
 		 677 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  43.2 
 
 		 674 aa  530  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  40.41 
 
 		 677 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  40.77 
 
 		 677 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  40.48 
 
 		 680 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  39.09 
 
 		 670 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  40.21 
 
 		 667 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  39.52 
 
 		 663 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  40.06 
 
 		 677 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  41.04 
 
 		 668 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  40.09 
 
 		 673 aa  502  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  39.7 
 
 		 678 aa  498  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  40.51 
 
 		 674 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  40.21 
 
 		 690 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  41.52 
 
 		 668 aa  488  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  44.15 
 
 		 690 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  38.1 
 
 		 670 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  38.54 
 
 		 670 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  37.94 
 
 		 714 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  38.05 
 
 		 667 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  37.9 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  35.47 
 
 		 704 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  34.3 
 
 		 711 aa  389  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0269  peptidase S15  36.42 
 
 		 745 aa  313  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485084  normal  0.582003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  34.75 
 
 		 705 aa  303  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.31 
 
 		 550 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.02 
 
 		 534 aa  154  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.39 
 
 		 647 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  27.24 
 
 		 555 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  29.5 
 
 		 571 aa  151  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.29 
 
 		 594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.91 
 
 		 625 aa  148  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.11 
 
 		 588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.09 
 
 		 611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.16 
 
 		 595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  25.41 
 
 		 595 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  28.9 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  26.79 
 
 		 673 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  23.57 
 
 		 547 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  28.57 
 
 		 576 aa  124  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.19 
 
 		 587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.82 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  25.66 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  25.13 
 
 		 615 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  23.9 
 
 		 641 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  25.27 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  24.95 
 
 		 668 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  24.81 
 
 		 542 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  23.15 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  23.55 
 
 		 541 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.08 
 
 		 570 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.96 
 
 		 605 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.51 
 
 		 577 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  21.98 
 
 		 540 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  24.34 
 
 		 668 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.67 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  25.18 
 
 		 612 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.88 
 
 		 529 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  25.14 
 
 		 644 aa  100  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  25.23 
 
 		 686 aa  100  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.91 
 
 		 561 aa  99.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.39 
 
 		 568 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  22.43 
 
 		 653 aa  97.1  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.24 
 
 		 678 aa  96.3  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  22.51 
 
 		 637 aa  95.5  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  27 
 
 		 503 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  26.04 
 
 		 655 aa  94.7  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.76 
 
 		 545 aa  94  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  26.84 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  23.5 
 
 		 638 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  35.06 
 
 		 645 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  21.21 
 
 		 637 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.4 
 
 		 599 aa  92  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.25 
 
 		 645 aa  91.7  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  24.95 
 
 		 545 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  32.12 
 
 		 499 aa  90.9  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.44 
 
 		 666 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.92 
 
 		 611 aa  90.5  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  22.14 
 
 		 636 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  25.05 
 
 		 549 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  34.48 
 
 		 626 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.48 
 
 		 626 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.49 
 
 		 609 aa  88.6  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1938  hydrolase CocE/NonD family protein  24.12 
 
 		 644 aa  88.2  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  24.76 
 
 		 544 aa  87  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.47 
 
 		 629 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.84 
 
 		 576 aa  85.5  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.8 
 
 		 625 aa  85.5  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  24.09 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  23.24 
 
 		 618 aa  84.3  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  22.28 
 
 		 625 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  20.45 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1297  acylase and diesterase protein  26.55 
 
 		 608 aa  82.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.36424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11190  putative hydrolase, CocE/NonD family  24.38 
 
 		 581 aa  82.4  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290865  normal  0.803564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>