More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2177 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  85.38 
 
 		 260 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  82.31 
 
 		 260 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  81.71 
 
 		 262 aa  408  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  77.91 
 
 		 264 aa  398  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  52.87 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  54.02 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  52.87 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  54.02 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  52.87 
 
 		 297 aa  275  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  53.64 
 
 		 261 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  53.64 
 
 		 261 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  52.87 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  52.87 
 
 		 261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  52.87 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  52.87 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  52.87 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  52.87 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  53.26 
 
 		 261 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  52.49 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  41.34 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  43.89 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 268 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.64 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.64 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 		 797 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  42 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  37.17 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  37.7 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  42.79 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>