More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2065 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  100 
 
 		 542 aa  1116    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  46.01 
 
 		 581 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  43.17 
 
 		 563 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  40.26 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  41.46 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  39.85 
 
 		 533 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  40.37 
 
 		 543 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  39.15 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  36.88 
 
 		 582 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  37.99 
 
 		 584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  36.69 
 
 		 578 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  37.94 
 
 		 563 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  36.08 
 
 		 536 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  37.18 
 
 		 536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  36.81 
 
 		 536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  36.76 
 
 		 772 aa  301  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  35.54 
 
 		 778 aa  299  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  36.33 
 
 		 766 aa  298  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  34.43 
 
 		 563 aa  296  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  35.27 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  33.33 
 
 		 616 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  35.08 
 
 		 534 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  37.2 
 
 		 609 aa  291  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  33.83 
 
 		 541 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  35.12 
 
 		 555 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  34.02 
 
 		 556 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  36.21 
 
 		 542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  34.7 
 
 		 534 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  37.34 
 
 		 596 aa  283  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37138  Arylsulfatase (AS) (Aryl-sulfate sulphohydrolase)  32.91 
 
 		 565 aa  276  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.218235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3073  arylsulfatase  32.05 
 
 		 784 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3832  sulfatase  31.57 
 
 		 784 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2363  sulfatase  33.63 
 
 		 783 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2516  sulfatase  33.52 
 
 		 786 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.424858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0111  sulfatase  32.91 
 
 		 786 aa  266  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00321161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0534  sulfatase  34.48 
 
 		 757 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.966586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3535  putative arylsulfatase  33.58 
 
 		 759 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3283  sulfatase  31.12 
 
 		 799 aa  263  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326754  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5423  arylsulfatase  30.61 
 
 		 660 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.634686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2470  sulfatase  32.66 
 
 		 786 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3132  sulfatase  31.46 
 
 		 798 aa  256  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000329231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0533  sulfatase  32.55 
 
 		 796 aa  254  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2930  sulfatase  30.73 
 
 		 798 aa  250  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0511457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3964  sulfatase  32.59 
 
 		 793 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4038  sulfatase  32.59 
 
 		 793 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3978  sulfatase  32.59 
 
 		 793 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0573144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2521  sulfatase  32.29 
 
 		 770 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.673679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2518  sulfatase  33.88 
 
 		 765 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.606572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26220  arylsulfatase A family protein  31.42 
 
 		 787 aa  248  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0762  sulfatase  31.02 
 
 		 773 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3364  arylsulfatase  33.27 
 
 		 579 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244969  normal  0.949476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3297  arylsulfatase  33.27 
 
 		 579 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.978245  normal  0.995381 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3466  arylsulfatase  33.27 
 
 		 579 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4134  sulfatase  32.11 
 
 		 788 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3371  arylsulfatase  33.27 
 
 		 579 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.64108  normal  0.82619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1640  sulfatase  31.26 
 
 		 822 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139745  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1085  sulfatase  30.67 
 
 		 819 aa  243  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.141132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0733  sulfatase  31.32 
 
 		 777 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5130  sulfatase  30.39 
 
 		 649 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.173338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  31.15 
 
 		 560 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13328  arylsulfatase atsB (aryl-sulfate sulphohydrolase)  32.85 
 
 		 970 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00105728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4474  sulfatase  29.49 
 
 		 648 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2406  sulfatase  30.22 
 
 		 775 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214932  decreased coverage  0.00167669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3543  sulfatase  30.37 
 
 		 656 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3976  sulfatase  30.37 
 
 		 656 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0677618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0599  putative arylsulfatase  30.13 
 
 		 762 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4647  sulfatase  31.51 
 
 		 640 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2584  sulfatase  30.61 
 
 		 652 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4467  sulfatase  31.05 
 
 		 777 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3261  sulfatase  31.62 
 
 		 785 aa  236  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0125079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3454  sulfatase  30.18 
 
 		 649 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5313  sulfatase  31.76 
 
 		 612 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000397774  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5276  sulfatase  29.74 
 
 		 649 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3065  sulfatase  31.45 
 
 		 786 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5494  sulfatase  31.96 
 
 		 780 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309233  normal  0.572846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10725  arylsulfatase atsA (aryl-sulfate sulphohydrolase)  30.95 
 
 		 787 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64546  normal  0.178722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2522  sulfatase  31.81 
 
 		 789 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0761  sulfatase  29.71 
 
 		 785 aa  230  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.492542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5039  sulfatase  29.78 
 
 		 783 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0252328  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2400  sulfatase  30.07 
 
 		 589 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0292447  hitchhiker  0.00582616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2372  sulfatase  32.1 
 
 		 787 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.973835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1023  sulfatase  29.78 
 
 		 783 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1040  sulfatase  29.78 
 
 		 783 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.088448  normal  0.214837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2374  sulfatase  30.68 
 
 		 802 aa  223  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2516  sulfatase  29.53 
 
 		 795 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4108  sulfatase  32.48 
 
 		 756 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04271  sulfatase  30.52 
 
 		 786 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1858  sulfatase  29.82 
 
 		 783 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1052  sulfatase  29.6 
 
 		 783 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1317  sulfatase  28.68 
 
 		 784 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2420  sulfatase  30.74 
 
 		 840 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.73372  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0936  sulfatase  30.41 
 
 		 833 aa  219  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3235  sulfatase  31.07 
 
 		 787 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1480  sulfatase  31.17 
 
 		 789 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10676  arylsulfatase atsD (aryl-sulfate sulphohydrolase)  30.5 
 
 		 787 aa  217  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  32.2 
 
 		 453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3143  sulfatase  29.31 
 
 		 790 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.690214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2074  sulfatase  29.65 
 
 		 789 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0763  sulfatase  29.3 
 
 		 791 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1901  sulfatase  29.65 
 
 		 789 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>