21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1966 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  36.54 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  36.19 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  33.2 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  44.29 
 
 		 146 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  36.1 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  50 
 
 		 154 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  46.85 
 
 		 127 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  41.67 
 
 		 143 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  39.81 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  33.96 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  34.62 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  41.51 
 
 		 170 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  36.54 
 
 		 122 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  35.78 
 
 		 124 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  35.51 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3319  SNase-like nuclease  37.37 
 
 		 158 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  31.61 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 143 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  37.78 
 
 		 171 aa  42  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  33.93 
 
 		 192 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>