215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1797 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  56.42 
 
 
221 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  51.74 
 
 
228 aa  241  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.92 
 
 
217 aa  236  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  54.85 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47 
 
 
219 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.24 
 
 
221 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  48.8 
 
 
221 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.85 
 
 
221 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.67 
 
 
212 aa  188  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  45.16 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  46.53 
 
 
198 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  49.49 
 
 
204 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.41 
 
 
204 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.63 
 
 
204 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  44.33 
 
 
200 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  42.66 
 
 
221 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  44.39 
 
 
215 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  44.78 
 
 
199 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.5 
 
 
201 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  46.35 
 
 
205 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  50.25 
 
 
203 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.26 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.54 
 
 
204 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  42.27 
 
 
208 aa  141  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  43.15 
 
 
214 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.8 
 
 
209 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.69 
 
 
196 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.93 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.5 
 
 
201 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.15 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.26 
 
 
217 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  41.26 
 
 
217 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  41.26 
 
 
217 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.46 
 
 
209 aa  128  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  39.18 
 
 
178 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.6 
 
 
200 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.06 
 
 
194 aa  121  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.98 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
202 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.79 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.6 
 
 
181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  34.15 
 
 
213 aa  119  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  37.02 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  38.02 
 
 
181 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
224 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  34.55 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  33.51 
 
 
181 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.27 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  36.98 
 
 
183 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.28 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.2 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36 
 
 
192 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.85 
 
 
204 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.94 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
180 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.77 
 
 
183 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.46 
 
 
180 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.98 
 
 
180 aa  104  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  34.2 
 
 
178 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 
178 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.35 
 
 
199 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
183 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  30.89 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  32.64 
 
 
178 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  40.74 
 
 
179 aa  91.3  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.14 
 
 
188 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.96 
 
 
183 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.51 
 
 
187 aa  88.6  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.21 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
187 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 
157 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
181 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.82 
 
 
183 aa  84.7  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.83 
 
 
208 aa  84.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.18 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.97 
 
 
185 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.84 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.69 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.21 
 
 
181 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.02 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.15 
 
 
188 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.36 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.91 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.18 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.9 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.16 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  30.95 
 
 
181 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  32.51 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>