More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1699 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  100 
 
 		 355 aa  719    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  51.54 
 
 		 364 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  52.86 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  52.6 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 335 aa  355  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  51.43 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  55.31 
 
 		 332 aa  353  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  50.14 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  50.42 
 
 		 369 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  49.18 
 
 		 369 aa  348  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.69 
 
 		 365 aa  348  9e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  51.28 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  53.82 
 
 		 325 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  54.47 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  52.29 
 
 		 333 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  52.01 
 
 		 350 aa  346  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 		 333 aa  345  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  49.3 
 
 		 369 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  50.28 
 
 		 369 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  49.58 
 
 		 368 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  49.58 
 
 		 368 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  51.71 
 
 		 334 aa  344  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  51.14 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  49.86 
 
 		 369 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.97 
 
 		 370 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  51.16 
 
 		 336 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  50.7 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3168  ABC transporter related  51.52 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0198252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  51.29 
 
 		 332 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  50 
 
 		 369 aa  342  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  52.91 
 
 		 325 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.42 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.86 
 
 		 369 aa  342  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 388 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  49.3 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  52.11 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  51.29 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  50.14 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  51.29 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  51.52 
 
 		 332 aa  339  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  52.45 
 
 		 334 aa  339  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  50.43 
 
 		 333 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  48.87 
 
 		 342 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  50.86 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  48.91 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  50 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  50.29 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  49.71 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  51.45 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  51.53 
 
 		 359 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  51.92 
 
 		 391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  48.17 
 
 		 360 aa  335  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  50.14 
 
 		 332 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  50 
 
 		 361 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  45.48 
 
 		 371 aa  335  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  48.62 
 
 		 368 aa  335  9e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  48.6 
 
 		 360 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.45 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  52.05 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  50.86 
 
 		 342 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  51.12 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.28 
 
 		 370 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  50 
 
 		 370 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 378 aa  332  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  51.71 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  50.98 
 
 		 377 aa  332  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  49.02 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  50 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  50.29 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  49.73 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  48.86 
 
 		 333 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  47.78 
 
 		 359 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  53.63 
 
 		 361 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 381 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  48.03 
 
 		 353 aa  328  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  49 
 
 		 357 aa  328  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 		 351 aa  328  7e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  48.86 
 
 		 345 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.55 
 
 		 359 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  49.28 
 
 		 353 aa  328  8e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4396  ABC transporter related  49.72 
 
 		 370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.625138  normal  0.658591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  52.03 
 
 		 351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 		 351 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  50 
 
 		 338 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  49.72 
 
 		 366 aa  326  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 368 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 		 349 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 		 333 aa  325  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  49.86 
 
 		 365 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  48.06 
 
 		 361 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.44 
 
 		 351 aa  325  9e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  50.72 
 
 		 352 aa  325  9e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>