More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1554 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  745    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  63.71 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  65.67 
 
 		 376 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  63.52 
 
 		 383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  57.89 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  55.7 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  57.58 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  57.72 
 
 		 391 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  48.53 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  48.23 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  47.53 
 
 		 381 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  52.57 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  47.53 
 
 		 382 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  49.86 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  45.57 
 
 		 383 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  48.31 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  49.7 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  50.15 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  44.81 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  46.28 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  50.3 
 
 		 382 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  46.22 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  45.26 
 
 		 383 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  48.2 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  44.95 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  44.24 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  42.9 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  47.62 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  50 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  44.54 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  39.74 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  43.15 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  40.72 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  43.67 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  42.94 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  38.54 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  42.33 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  43.34 
 
 		 366 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  41.86 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  38.87 
 
 		 406 aa  222  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  36.72 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  36.86 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  38.62 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  37.69 
 
 		 365 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  38.36 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  35.19 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  38.18 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  36.89 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  37.74 
 
 		 371 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  37.88 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  37 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  35.55 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  34.86 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  37.78 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  37.78 
 
 		 381 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  33.53 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  39.14 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  37.11 
 
 		 377 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  35.39 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  36.49 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  35.39 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  33.24 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  37.26 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  36.01 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  35.99 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  32.6 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  34.79 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  35.51 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  38.49 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  32.87 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  31.56 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  31.3 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  36.67 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  30.62 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  34.96 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  30.9 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  34.67 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  30.9 
 
 		 369 aa  176  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  32.72 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  33.33 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  35.98 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  28.06 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  34.64 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  34.11 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  34.2 
 
 		 374 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  42.11 
 
 		 386 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  35.09 
 
 		 374 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  33.78 
 
 		 374 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  43.54 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  33.99 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  32.78 
 
 		 368 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  41.92 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  40.85 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  34.26 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  34.26 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  32.51 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  42.33 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  35.25 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>