More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1534 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 289 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  70.14 
 
 		 289 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  71.06 
 
 		 289 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  62.87 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  61.82 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1412  dihydropteroate synthase  61.76 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2246  dihydropteroate synthase  64.6 
 
 		 297 aa  302  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  57.4 
 
 		 282 aa  301  9e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  46.54 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  50.75 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  51.54 
 
 		 278 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  48.31 
 
 		 400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  44.7 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  46.4 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  50.75 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  48.7 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 393 aa  224  9e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  48.08 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  51.34 
 
 		 289 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  45.53 
 
 		 402 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  48.28 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  41.48 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 		 277 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 280 aa  215  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.85 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.85 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  42.42 
 
 		 274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 		 291 aa  211  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  44.96 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  43.58 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 		 394 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 		 277 aa  208  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  44.96 
 
 		 278 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  41.88 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  45.68 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  42.15 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  39.51 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  43.61 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  40.51 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  40.51 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  42.59 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  41.58 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  41.58 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  41.58 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  41.58 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  41.58 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  41.58 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  41.58 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  41.58 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  40.51 
 
 		 277 aa  202  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  40.89 
 
 		 287 aa  201  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  45.24 
 
 		 285 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  41.37 
 
 		 301 aa  201  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  42.44 
 
 		 347 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  41.22 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  49.04 
 
 		 271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  41.34 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  37.76 
 
 		 412 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  45.29 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  41.61 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  42.65 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  42.65 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  42.65 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  42.65 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  41.63 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  44.28 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  40.89 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  42.29 
 
 		 282 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  41.25 
 
 		 277 aa  195  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  42.49 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  45.14 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  47.55 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  41.25 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  40.93 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  40.98 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  40.98 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  39.19 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>