More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1458 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  100 
 
 		 279 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  85.35 
 
 		 274 aa  494  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  84.62 
 
 		 278 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  83.88 
 
 		 278 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  83.52 
 
 		 278 aa  484  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  83.03 
 
 		 275 aa  474  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  83.03 
 
 		 299 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  81.92 
 
 		 275 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  71.75 
 
 		 276 aa  418  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  68.86 
 
 		 274 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  68.86 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  68.52 
 
 		 275 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  69.26 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  67.77 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  66.67 
 
 		 273 aa  387  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  68.15 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  68.13 
 
 		 273 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  66.3 
 
 		 271 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  66.3 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  71.03 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  70.63 
 
 		 284 aa  370  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  64.96 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  69.05 
 
 		 275 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  69.84 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  70.63 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  68.65 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  64.81 
 
 		 279 aa  362  5.0000000000000005e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  61.54 
 
 		 279 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  64.84 
 
 		 283 aa  352  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  60.89 
 
 		 274 aa  350  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  64.31 
 
 		 271 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  62.07 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  61.48 
 
 		 279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  63.85 
 
 		 293 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  62.99 
 
 		 271 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  63.1 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  63.39 
 
 		 293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  63.39 
 
 		 293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  61.02 
 
 		 271 aa  332  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  60.55 
 
 		 276 aa  322  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  60.73 
 
 		 261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  59.84 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  59.11 
 
 		 260 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  59.11 
 
 		 260 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  59.11 
 
 		 260 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  59.11 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  56.68 
 
 		 261 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  56.68 
 
 		 261 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  57.49 
 
 		 260 aa  292  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  56.68 
 
 		 260 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  58.92 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  55.19 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  55.2 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  55.2 
 
 		 259 aa  284  9e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  55.06 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  54.96 
 
 		 255 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  53.53 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  55.89 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  55.42 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  55.6 
 
 		 261 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  55.73 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  55.06 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  54.55 
 
 		 267 aa  275  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  54.37 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  52.8 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  52.34 
 
 		 260 aa  272  5.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  51.37 
 
 		 266 aa  271  1e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  52.33 
 
 		 262 aa  270  1e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  53.17 
 
 		 262 aa  270  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  56.18 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  52 
 
 		 269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  52 
 
 		 269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3610  methionine aminopeptidase, type I  53.54 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  55.46 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  52.19 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  55.46 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 266 aa  265  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  55.46 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  52.76 
 
 		 271 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  52.76 
 
 		 271 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  53.47 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  52.21 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  50.8 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  51.61 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  52.03 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  53.2 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1820  methionine aminopeptidase, type I  53.73 
 
 		 277 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  51.63 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  52.23 
 
 		 253 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  51.56 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3100  methionine aminopeptidase, type I  52.36 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.612073  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  52.03 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  52.59 
 
 		 262 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  51.46 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  54.01 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  52.03 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>