More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1439 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 389 aa  793    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  76.35 
 
 		 389 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  77.18 
 
 		 390 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  72.16 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  71.98 
 
 		 389 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  71.47 
 
 		 389 aa  584  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  70.44 
 
 		 389 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  64.78 
 
 		 389 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  64.25 
 
 		 388 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  62.95 
 
 		 388 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  63.82 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  62.79 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 		 388 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  62.53 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  61.78 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  63.02 
 
 		 389 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  62.53 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  60.78 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  62.02 
 
 		 389 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  60.94 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  59.59 
 
 		 386 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  59.11 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  61.72 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  53.91 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  51.44 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  51.3 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 		 388 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  52.45 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  49.34 
 
 		 392 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  37.97 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  36.22 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  36.8 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.44 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.79 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  36.73 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  36.06 
 
 		 387 aa  212  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  35.03 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.85 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  36.29 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  38.19 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  36.78 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  36.93 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.04 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  34.53 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  36.02 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.83 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.33 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.74 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.67 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.43 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  37.57 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.25 
 
 		 386 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.67 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.37 
 
 		 388 aa  182  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.67 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.6 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  34.3 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  35 
 
 		 412 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  37.15 
 
 		 406 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.2 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.68 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  34.1 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  35.37 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  34.61 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.73 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.35 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1808  acetyl-CoA acetyltransferase  35.42 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  34.47 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34.76 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.57 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  36.24 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0865761  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.13 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  34.19 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  33.67 
 
 		 386 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.19 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  31.71 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.55 
 
 		 376 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  34.16 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  32.66 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  33.83 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.77 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  35.2 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  29.55 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.47 
 
 		 390 aa  163  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  33.41 
 
 		 421 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.91 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  32.31 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  30.75 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  30.75 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  30.75 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3099  acetyl-CoA acetyltransferase  33.57 
 
 		 410 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3159  acetyl-CoA acetyltransferase  33.57 
 
 		 410 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  29.8 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3119  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0259344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  34.66 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.5 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  35.18 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>