More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1401 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  77.32 
 
 		 701 aa  1124    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.99 
 
 		 686 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.78 
 
 		 695 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.96 
 
 		 706 aa  912    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.68 
 
 		 706 aa  910    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.53 
 
 		 706 aa  907    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.54 
 
 		 731 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  55.35 
 
 		 699 aa  739    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.64 
 
 		 695 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.01 
 
 		 729 aa  716    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.83 
 
 		 700 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.91 
 
 		 704 aa  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.8 
 
 		 750 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 701 aa  1406    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  55.7 
 
 		 728 aa  701    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.36 
 
 		 700 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.64 
 
 		 695 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  56.35 
 
 		 699 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.9 
 
 		 704 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  55.78 
 
 		 727 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  54.64 
 
 		 699 aa  704    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.64 
 
 		 696 aa  664    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.92 
 
 		 690 aa  721    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.07 
 
 		 696 aa  664    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.39 
 
 		 702 aa  840    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.45 
 
 		 729 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  75.04 
 
 		 790 aa  1085    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.99 
 
 		 694 aa  691    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.45 
 
 		 729 aa  708    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.44 
 
 		 702 aa  803    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.41 
 
 		 694 aa  775    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.7 
 
 		 700 aa  695    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  76.46 
 
 		 701 aa  1107    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.71 
 
 		 697 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.78 
 
 		 697 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.08 
 
 		 703 aa  625  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.28 
 
 		 691 aa  609  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  48.65 
 
 		 685 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.99 
 
 		 723 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.77 
 
 		 679 aa  570  1e-161  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.08 
 
 		 701 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.2 
 
 		 673 aa  552  1e-156  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  41.47 
 
 		 678 aa  555  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.8 
 
 		 709 aa  537  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.88 
 
 		 704 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.88 
 
 		 704 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.61 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.71 
 
 		 693 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.07 
 
 		 692 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.74 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.51 
 
 		 692 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.99 
 
 		 690 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.69 
 
 		 690 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 686 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.51 
 
 		 692 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  44 
 
 		 686 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.88 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.71 
 
 		 712 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.56 
 
 		 692 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.55 
 
 		 689 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.4 
 
 		 693 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.04 
 
 		 693 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.04 
 
 		 693 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 		 691 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.77 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.04 
 
 		 693 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.34 
 
 		 705 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.95 
 
 		 693 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.36 
 
 		 691 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.71 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 		 697 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.14 
 
 		 765 aa  489  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.44 
 
 		 693 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.29 
 
 		 747 aa  488  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.36 
 
 		 697 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.17 
 
 		 818 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.55 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.98 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 696 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.6 
 
 		 696 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 696 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 696 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.32 
 
 		 772 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.5 
 
 		 819 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  43 
 
 		 691 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 696 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.41 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 696 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.51 
 
 		 693 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 		 703 aa  479  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.72 
 
 		 815 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.65 
 
 		 693 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.8 
 
 		 691 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.93 
 
 		 691 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2283  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.38 
 
 		 692 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.35 
 
 		 819 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.12 
 
 		 696 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>