More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1365 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
287 aa  585  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  64.41 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  67.03 
 
 
289 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  65.23 
 
 
289 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  64.64 
 
 
284 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  63.93 
 
 
284 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  63.93 
 
 
284 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  59.29 
 
 
281 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  56.36 
 
 
280 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  54.91 
 
 
280 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  52.33 
 
 
283 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  51.79 
 
 
286 aa  291  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  52.9 
 
 
281 aa  291  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  53.28 
 
 
282 aa  288  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.02 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.82 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  51.84 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
284 aa  281  9e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  51.62 
 
 
282 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  51.27 
 
 
282 aa  278  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  51.09 
 
 
282 aa  278  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  50.18 
 
 
282 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.18 
 
 
282 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.54 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  48.21 
 
 
286 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.68 
 
 
285 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.31 
 
 
285 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.1 
 
 
285 aa  254  9e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  47.27 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.48 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  49.64 
 
 
284 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.96 
 
 
285 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.04 
 
 
287 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.88 
 
 
284 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.88 
 
 
284 aa  249  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  41.88 
 
 
284 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.91 
 
 
281 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.55 
 
 
316 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.01 
 
 
289 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  46.64 
 
 
292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  43.22 
 
 
281 aa  242  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.32 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.44 
 
 
284 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.22 
 
 
280 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.22 
 
 
280 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.22 
 
 
280 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.22 
 
 
280 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.22 
 
 
280 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.18 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.65 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.84 
 
 
281 aa  232  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.45 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  42.45 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.45 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.45 
 
 
281 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.45 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  42.45 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.04 
 
 
279 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.09 
 
 
281 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.09 
 
 
281 aa  228  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44 
 
 
289 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  43.21 
 
 
288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.37 
 
 
285 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  41.13 
 
 
283 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  42.12 
 
 
284 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.11 
 
 
276 aa  202  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  37.09 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  37.09 
 
 
276 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  40.28 
 
 
304 aa  194  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  39.64 
 
 
290 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  43.16 
 
 
276 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  37.14 
 
 
282 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  38.99 
 
 
284 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  35.82 
 
 
276 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 
288 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  36.86 
 
 
286 aa  185  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.26 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  35.64 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.3 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  37.01 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.59 
 
 
285 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  37.01 
 
 
285 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.24 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  37.01 
 
 
285 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.04 
 
 
285 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  38.03 
 
 
285 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  38.17 
 
 
255 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.44 
 
 
284 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  38.79 
 
 
291 aa  171  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  36.71 
 
 
278 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  37.82 
 
 
344 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.79 
 
 
283 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  37.15 
 
 
290 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60020  thiosulfate sulfurtransferase  38.97 
 
 
310 aa  163  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.509685  normal  0.0271874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.21 
 
 
285 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  36.97 
 
 
282 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17215  predicted protein  34.15 
 
 
297 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  39.93 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  31.8 
 
 
277 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>