More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1249 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  79.08 
 
 		 155 aa  254  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  78.71 
 
 		 175 aa  253  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  74.19 
 
 		 155 aa  245  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  76 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  76 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  75.33 
 
 		 156 aa  236  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  69.87 
 
 		 157 aa  233  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  63.45 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  61.64 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 160 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  56.67 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 176 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 159 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  56 
 
 		 170 aa  167  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  52.82 
 
 		 170 aa  147  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 168 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.08 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.04 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.52 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  41.96 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  43.42 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  43.42 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  43.42 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 181 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  41.1 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>