More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1144 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  70.23 
 
 		 433 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  70.89 
 
 		 432 aa  653    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  79.44 
 
 		 434 aa  740    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  73.18 
 
 		 427 aa  683    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  100 
 
 		 429 aa  899    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  86.48 
 
 		 430 aa  800    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  69.05 
 
 		 436 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  70.23 
 
 		 433 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1806  citrate synthase  73.54 
 
 		 430 aa  666    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.218068 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  75.99 
 
 		 430 aa  719    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  70.23 
 
 		 433 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  82.05 
 
 		 446 aa  756    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  83.92 
 
 		 430 aa  772    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  78.79 
 
 		 429 aa  728    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  70.21 
 
 		 433 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  69.07 
 
 		 433 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  68.6 
 
 		 431 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  69.3 
 
 		 433 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  78.04 
 
 		 433 aa  729    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  70.07 
 
 		 433 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  70.23 
 
 		 433 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  73.24 
 
 		 428 aa  669    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  69.3 
 
 		 433 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  70.23 
 
 		 433 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  86.25 
 
 		 430 aa  803    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  70.23 
 
 		 433 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  70.23 
 
 		 433 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  73.24 
 
 		 428 aa  670    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  69.53 
 
 		 429 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  72.52 
 
 		 433 aa  670    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  70.47 
 
 		 433 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  86.48 
 
 		 435 aa  800    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  78.5 
 
 		 434 aa  729    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  73.66 
 
 		 428 aa  682    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  69.3 
 
 		 433 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  71.13 
 
 		 430 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  78.27 
 
 		 434 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  69.3 
 
 		 432 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  69.53 
 
 		 432 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  69.53 
 
 		 433 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  91.61 
 
 		 429 aa  843    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  77.34 
 
 		 434 aa  729    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  78.97 
 
 		 434 aa  738    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  76.64 
 
 		 433 aa  715    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  69.3 
 
 		 433 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  72.2 
 
 		 431 aa  676    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  74.12 
 
 		 427 aa  679    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  69.3 
 
 		 433 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  82.31 
 
 		 429 aa  754    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  87.41 
 
 		 429 aa  805    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  83.45 
 
 		 430 aa  769    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  80.89 
 
 		 429 aa  751    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  82.05 
 
 		 429 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  70 
 
 		 433 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  75.53 
 
 		 434 aa  694    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  69.3 
 
 		 433 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  70 
 
 		 433 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  69.3 
 
 		 433 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  86.71 
 
 		 429 aa  797    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  73.71 
 
 		 428 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  82.52 
 
 		 429 aa  759    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  72.77 
 
 		 430 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  70.88 
 
 		 428 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  79.06 
 
 		 438 aa  723    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  91.61 
 
 		 429 aa  840    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  83.57 
 
 		 436 aa  766    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  68.79 
 
 		 424 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  68.6 
 
 		 429 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  68.66 
 
 		 436 aa  631  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  68.97 
 
 		 433 aa  631  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  68.66 
 
 		 436 aa  631  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  70.66 
 
 		 439 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  69.23 
 
 		 426 aa  633  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  67.99 
 
 		 431 aa  627  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  67.91 
 
 		 429 aa  628  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3605  type II citrate synthase  67.97 
 
 		 436 aa  628  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.113528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  68.14 
 
 		 433 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  68.84 
 
 		 427 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  68.13 
 
 		 437 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  68.38 
 
 		 429 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  67.14 
 
 		 425 aa  625  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  68.85 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  68.38 
 
 		 429 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  68.53 
 
 		 432 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  67.28 
 
 		 436 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  67.97 
 
 		 436 aa  626  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3037  type II citrate synthase  67.51 
 
 		 436 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  68.6 
 
 		 427 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2701  type II citrate synthase  67.44 
 
 		 437 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0134767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  67.91 
 
 		 429 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  72.08 
 
 		 428 aa  622  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2146  type II citrate synthase  68.37 
 
 		 433 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  69.03 
 
 		 436 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  67.67 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  68.6 
 
 		 427 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  68.6 
 
 		 427 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  68.6 
 
 		 427 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  66.44 
 
 		 433 aa  621  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  68.38 
 
 		 429 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  72.08 
 
 		 428 aa  621  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>